182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2989 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  61.34 
 
 		 590 aa  757    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 588 aa  1215    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  51.1 
 
 		 596 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  50.34 
 
 		 589 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  42.93 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  41.69 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  41.04 
 
 		 576 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  41.23 
 
 		 606 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  31.34 
 
 		 611 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 579 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  30.03 
 
 		 550 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 602 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 650 aa  163  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  30.87 
 
 		 612 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  29.45 
 
 		 577 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 571 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 631 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 531 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 540 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 584 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 565 aa  104  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 633 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 587 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 607 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 557 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 639 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 557 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 549 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 630 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 582 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 587 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 541 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 615 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 583 aa  84  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 527 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 511 aa  80.1  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.03 
 
 		 499 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  23.11 
 
 		 600 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 568 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  23.2 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 540 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 636 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 579 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 508 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 601 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 548 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 481 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 623 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 555 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  24.13 
 
 		 595 aa  67.4  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 582 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 614 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 620 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 520 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  21.82 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  22.7 
 
 		 617 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 568 aa  64.7  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 592 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 527 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.75 
 
 		 498 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 588 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  25.9 
 
 		 667 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 594 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 584 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 512 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  21.58 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  22.8 
 
 		 523 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  37.38 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  23.86 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  22.48 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>