133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6390 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 1483 aa  2997    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  35.65 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1147 aa  122  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  33.49 
 
 		 599 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  32.41 
 
 		 4013 aa  105  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  28.07 
 
 		 3737 aa  103  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  31.88 
 
 		 2005 aa  101  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  25.29 
 
 		 2402 aa  99.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  39.86 
 
 		 2377 aa  98.6  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  46.53 
 
 		 3793 aa  96.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1059 aa  95.9  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  43.68 
 
 		 4896 aa  94.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  43.43 
 
 		 3927 aa  92.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1547 aa  89.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  28.23 
 
 		 2262 aa  89  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1665 aa  88.6  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  42.05 
 
 		 750 aa  87.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1228 aa  87  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1804 aa  85.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  40.22 
 
 		 3471 aa  85.1  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  30.88 
 
 		 3602 aa  84.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1064 aa  84  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  43.27 
 
 		 1980 aa  82  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1259 aa  81.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  29.9 
 
 		 561 aa  81.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  27.49 
 
 		 3227 aa  80.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  43.53 
 
 		 581 aa  76.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  24.68 
 
 		 989 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  32.98 
 
 		 2772 aa  76.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  39.56 
 
 		 2270 aa  75.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  34.44 
 
 		 2421 aa  76.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  34.02 
 
 		 1463 aa  75.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.88 
 
 		 890 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  34.44 
 
 		 2367 aa  75.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  34.44 
 
 		 2411 aa  75.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  35.23 
 
 		 2454 aa  75.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  38.39 
 
 		 3324 aa  74.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  35.23 
 
 		 2807 aa  74.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  23.49 
 
 		 3191 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  28.91 
 
 		 759 aa  73.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  30.99 
 
 		 711 aa  73.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  26.8 
 
 		 885 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  37.08 
 
 		 1067 aa  70.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.48 
 
 		 822 aa  70.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  40.43 
 
 		 815 aa  69.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  34.75 
 
 		 648 aa  69.3  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  31.13 
 
 		 1152 aa  68.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  43.02 
 
 		 657 aa  67  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  36.47 
 
 		 1526 aa  66.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  28.72 
 
 		 799 aa  65.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  38.1 
 
 		 1111 aa  65.1  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.07 
 
 		 5745 aa  65.1  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  25 
 
 		 627 aa  65.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.79 
 
 		 2713 aa  63.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  34.04 
 
 		 637 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  34.52 
 
 		 2927 aa  64.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  35.96 
 
 		 652 aa  64.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  42.11 
 
 		 2267 aa  63.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  39.08 
 
 		 735 aa  63.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  26.78 
 
 		 5298 aa  63.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  35.29 
 
 		 2296 aa  63.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  28.41 
 
 		 2478 aa  63.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  26.5 
 
 		 2487 aa  62.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  32.67 
 
 		 963 aa  62.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  32.67 
 
 		 969 aa  62.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  35.16 
 
 		 751 aa  62.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1461 aa  60.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  34.94 
 
 		 2588 aa  60.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  29.76 
 
 		 535 aa  61.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  38.61 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1139 aa  60.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  30.85 
 
 		 1371 aa  60.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.37 
 
 		 4071 aa  60.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  38.75 
 
 		 871 aa  59.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  32.95 
 
 		 2064 aa  59.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  34.04 
 
 		 1389 aa  59.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  39.44 
 
 		 1066 aa  58.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  32.89 
 
 		 689 aa  57.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.33 
 
 		 1657 aa  58.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  37.82 
 
 		 564 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1193 aa  58.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.11 
 
 		 6497 aa  57  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  28.57 
 
 		 874 aa  56.6  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  34.02 
 
 		 950 aa  57  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  34.02 
 
 		 968 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  34.88 
 
 		 2602 aa  56.6  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  34.83 
 
 		 3542 aa  56.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  26.26 
 
 		 532 aa  57  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1210 aa  55.8  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  32.69 
 
 		 1466 aa  55.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  36.9 
 
 		 1162 aa  55.5  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  32.95 
 
 		 794 aa  55.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  37.25 
 
 		 2833 aa  55.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  37.97 
 
 		 852 aa  54.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  28.35 
 
 		 534 aa  55.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1329 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2555  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1310 aa  53.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.942961  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  39.13 
 
 		 742 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1313 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1287 aa  52.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>