More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1131 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1131  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  493  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.543698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1130  hypothetical protein  34.02 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.396679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1128  hypothetical protein  35.44 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.499408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10788  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  30.13 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1111  hypothetical protein  29.46 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0805957 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3674  hypothetical protein  45.83 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  37.59 
 
 		 1050 aa  71.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 1076 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 1100 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1124 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1047 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  42.53 
 
 		 1155 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  40 
 
 		 1023 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  37.38 
 
 		 1104 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  37.04 
 
 		 1096 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1137 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1076 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1063 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1031 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1176 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 1045 aa  63.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  40.23 
 
 		 1075 aa  63.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  45.16 
 
 		 1023 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 982 aa  62.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1135 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  36.44 
 
 		 1105 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1041 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1177 aa  62.4  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  39.77 
 
 		 1089 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1161 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  39.68 
 
 		 1097 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  44.62 
 
 		 1148 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  39.08 
 
 		 1081 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  43.59 
 
 		 984 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  46.15 
 
 		 874 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1173 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1045 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 		 1062 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1188 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1059 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  46.88 
 
 		 1237 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  35.96 
 
 		 1003 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0004  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1130 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  40.74 
 
 		 1144 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 1189 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  38.14 
 
 		 1202 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1106 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  35.05 
 
 		 1128 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  46.88 
 
 		 1036 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1058 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 1128 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 		 993 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1017 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1946  hypothetical protein  37.5 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  50.77 
 
 		 1001 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1168 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0985  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.108599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  39.77 
 
 		 1103 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1026 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1013 aa  58.5  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0983  hypothetical protein  35.16 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.533153  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1051 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1153 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  34.48 
 
 		 1005 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  36.46 
 
 		 1049 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1148 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  38.1 
 
 		 1144 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  36.25 
 
 		 1024 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 1080 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 		 1083 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1148 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  36.46 
 
 		 1079 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.96 
 
 		 1008 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 1087 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1169 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1125 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1168 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  35.78 
 
 		 1219 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 1014 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1070 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1142 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1040 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1155 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 1039 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  38.64 
 
 		 1132 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  36.62 
 
 		 1109 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  31.87 
 
 		 1122 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1102 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  39.34 
 
 		 1138 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1019 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  35.8 
 
 		 1114 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  38.1 
 
 		 1016 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  34.74 
 
 		 1028 aa  56.2  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  39.06 
 
 		 1043 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1130 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  39.34 
 
 		 1102 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  39.06 
 
 		 1042 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 		 1181 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 1038 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 994 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>