128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0696 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  100 
 
 		 961 aa  1939    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 998 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  35.09 
 
 		 946 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  34.46 
 
 		 965 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  32.43 
 
 		 921 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  32.93 
 
 		 847 aa  425  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  31.83 
 
 		 952 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  30.78 
 
 		 929 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  31.16 
 
 		 930 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  30.9 
 
 		 924 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  28.46 
 
 		 887 aa  355  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  31.22 
 
 		 904 aa  331  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  29.54 
 
 		 920 aa  310  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  29.11 
 
 		 908 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  30.03 
 
 		 929 aa  306  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  28.92 
 
 		 872 aa  287  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.85 
 
 		 926 aa  278  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  26.43 
 
 		 944 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  25.63 
 
 		 946 aa  168  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25.6 
 
 		 915 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  31.31 
 
 		 895 aa  160  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  36.82 
 
 		 995 aa  148  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  34.44 
 
 		 936 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  34.92 
 
 		 826 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  32.68 
 
 		 800 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 824 aa  115  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 821 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 813 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 829 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 804 aa  110  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 973 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  30.07 
 
 		 805 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 818 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 822 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 766 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 830 aa  104  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 869 aa  104  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 853 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 817 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 		 805 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 810 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 934 aa  101  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 802 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 816 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 828 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  28.52 
 
 		 815 aa  99  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 791 aa  98.6  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 818 aa  97.8  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 852 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 814 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 832 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 808 aa  96.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 847 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 827 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 806 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 813 aa  92.8  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 820 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 817 aa  92  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 814 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.76 
 
 		 891 aa  89.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  25.82 
 
 		 877 aa  89  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 820 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 813 aa  85.1  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 803 aa  84.7  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  27.23 
 
 		 879 aa  84.3  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  26.7 
 
 		 823 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.64 
 
 		 894 aa  76.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 810 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 799 aa  71.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 819 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 866 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1015  tonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 750 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 777 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 988 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 798 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 833 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1066 aa  57  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 705 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 795 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 897 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  21.68 
 
 		 782 aa  55.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 938 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1087 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  23.84 
 
 		 715 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 883 aa  51.6  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 971 aa  51.6  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 866 aa  51.2  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 1105 aa  50.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 957 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1109 aa  50.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 759 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 922 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  23.05 
 
 		 748 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 931 aa  49.3  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 779 aa  48.9  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 776 aa  48.5  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>