140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0560 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0560  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 507 aa  1031    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0820449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  40.37 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.7 
 
 		 360 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  28.73 
 
 		 446 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  28.86 
 
 		 323 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2437  hypothetical protein  31.64 
 
 		 292 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.693761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0475  hypothetical protein  33.77 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  27.01 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.46 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  28.08 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  27.96 
 
 		 620 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  26.57 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 		 840 aa  60.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  23.63 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  25.25 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.1 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  25.12 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  26.2 
 
 		 733 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  52.17 
 
 		 257 aa  57  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  25.77 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  24.74 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  24.74 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.1 
 
 		 327 aa  55.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  24.9 
 
 		 580 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  24.35 
 
 		 514 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  22.16 
 
 		 517 aa  54.3  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  26.56 
 
 		 341 aa  53.9  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  27.72 
 
 		 483 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  27.72 
 
 		 483 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  27.72 
 
 		 483 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  31.55 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  23.76 
 
 		 552 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  23.56 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  54 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  41.07 
 
 		 283 aa  53.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  26.63 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  57.14 
 
 		 503 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  23.04 
 
 		 590 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  27.72 
 
 		 1021 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  22.59 
 
 		 511 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  27.17 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  23.96 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  23.88 
 
 		 554 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  34.21 
 
 		 301 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.08 
 
 		 1001 aa  52  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  24.17 
 
 		 518 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  25.54 
 
 		 527 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  24.62 
 
 		 519 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  25 
 
 		 338 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  23.71 
 
 		 617 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  36.92 
 
 		 253 aa  50.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  52.38 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  21.28 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  25.76 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.91 
 
 		 679 aa  50.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.03 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  27.17 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  47.83 
 
 		 242 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1681  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.67 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.86934  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.37 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  22.46 
 
 		 179 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  26.63 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  22.56 
 
 		 571 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 208 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  46.51 
 
 		 618 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  26.63 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  22.92 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22240  Peptidoglycan-binding LysM  39.34 
 
 		 619 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  22.52 
 
 		 515 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  22.92 
 
 		 515 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  40.38 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  22.92 
 
 		 515 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  22.34 
 
 		 546 aa  47.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  43.48 
 
 		 324 aa  47.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.62 
 
 		 255 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  44 
 
 		 301 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  52.27 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  22.92 
 
 		 515 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  47.73 
 
 		 128 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2063  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 445 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  48.94 
 
 		 2207 aa  47.4  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  19.57 
 
 		 539 aa  47.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  51.22 
 
 		 216 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  25.26 
 
 		 1079 aa  47.4  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  22.65 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1083  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.58 
 
 		 506 aa  47  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.91418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  44.23 
 
 		 303 aa  47  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.98 
 
 		 581 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  28.26 
 
 		 334 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  28.26 
 
 		 334 aa  47  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  21.94 
 
 		 307 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  21.33 
 
 		 553 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.63 
 
 		 289 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.43 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538528  normal  0.250383 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  44.9 
 
 		 271 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0164  Peptidase M23  39.71 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  25.35 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  48.84 
 
 		 286 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>