263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1061 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1061  ATPase-like protein  100 
 
 		 570 aa  1114    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318774  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  50 
 
 		 760 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  30.28 
 
 		 701 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  42.41 
 
 		 792 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  42.11 
 
 		 776 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  41.57 
 
 		 824 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  33.75 
 
 		 678 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  44.09 
 
 		 999 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  41.24 
 
 		 907 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  43.28 
 
 		 1102 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  43.24 
 
 		 960 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  41.23 
 
 		 1092 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1060  protein kinase  31.11 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0363505  normal  0.237814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  40.11 
 
 		 982 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  41.3 
 
 		 840 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 755 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  42.63 
 
 		 765 aa  123  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  38.67 
 
 		 1085 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 1082 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.56 
 
 		 1125 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 1137 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 969 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40.53 
 
 		 1119 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  42.71 
 
 		 1158 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  32.31 
 
 		 649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 775 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  39.15 
 
 		 1066 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 957 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.27 
 
 		 1056 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  36.22 
 
 		 777 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.78 
 
 		 1017 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 1227 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 781 aa  109  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 886 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  40.72 
 
 		 418 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 888 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 1058 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  40.74 
 
 		 780 aa  105  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 1100 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  33.64 
 
 		 1050 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  37.62 
 
 		 1087 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.32 
 
 		 1060 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  37.37 
 
 		 916 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  32.24 
 
 		 1010 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  36.31 
 
 		 1186 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 952 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 972 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 816 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 1094 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  39.44 
 
 		 943 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  39.11 
 
 		 799 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 1093 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 393 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 814 aa  99  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 921 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37 
 
 		 1043 aa  98.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 		 827 aa  98.2  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.71 
 
 		 1055 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 658 aa  97.4  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 928 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 		 818 aa  97.4  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 973 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  36.93 
 
 		 951 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 840 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 812 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 882 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  36.41 
 
 		 996 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 1042 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 877 aa  94  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.5 
 
 		 1058 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  29.57 
 
 		 950 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  33.01 
 
 		 1103 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 1085 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 943 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 726 aa  92  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 630 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  34.59 
 
 		 938 aa  90.5  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  33.88 
 
 		 490 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 831 aa  90.1  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.6 
 
 		 1072 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.04 
 
 		 1110 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  36.65 
 
 		 1064 aa  87.8  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 931 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  30.69 
 
 		 779 aa  87  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  32.97 
 
 		 1001 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 887 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  32.07 
 
 		 953 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3572  transcriptional regulator, LuxR family  33.52 
 
 		 914 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 966 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 		 961 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  31.96 
 
 		 797 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 804 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 601 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 956 aa  85.9  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 798 aa  85.5  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.93 
 
 		 1104 aa  85.1  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 910 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  36.81 
 
 		 878 aa  84.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  29.19 
 
 		 975 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>