More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1113 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  51.8 
 
 		 726 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  52.47 
 
 		 798 aa  749    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  49.1 
 
 		 749 aa  705    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  51.72 
 
 		 797 aa  723    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.13 
 
 		 731 aa  725    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  52.62 
 
 		 775 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.31 
 
 		 691 aa  727    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  48.89 
 
 		 723 aa  691    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  56.12 
 
 		 871 aa  813    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  52.38 
 
 		 722 aa  741    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  53.04 
 
 		 830 aa  789    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.35 
 
 		 731 aa  726    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  48.57 
 
 		 716 aa  658    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 824 aa  1632    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.66 
 
 		 782 aa  868    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  52.21 
 
 		 732 aa  718    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  51.05 
 
 		 770 aa  752    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  52.14 
 
 		 790 aa  747    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  50.76 
 
 		 695 aa  702    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  52.52 
 
 		 752 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  62.93 
 
 		 816 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  61.58 
 
 		 696 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  60.94 
 
 		 711 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  61.59 
 
 		 736 aa  572  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  57.11 
 
 		 691 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  59.92 
 
 		 710 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  57.94 
 
 		 701 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  58.15 
 
 		 770 aa  561  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  57.94 
 
 		 701 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  57.94 
 
 		 701 aa  560  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  58.69 
 
 		 920 aa  553  1e-156  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.45 
 
 		 712 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  57.93 
 
 		 707 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  58.87 
 
 		 703 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  54.96 
 
 		 962 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  55.94 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  57.63 
 
 		 706 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  41.38 
 
 		 708 aa  479  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  53.62 
 
 		 871 aa  478  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  39.52 
 
 		 691 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  39.72 
 
 		 691 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  39.27 
 
 		 691 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  39.65 
 
 		 691 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  39.75 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  39.52 
 
 		 691 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  39.65 
 
 		 746 aa  465  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  39.65 
 
 		 691 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  39.12 
 
 		 683 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  36.72 
 
 		 663 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  40.3 
 
 		 673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.74 
 
 		 673 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  37.01 
 
 		 681 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  37.26 
 
 		 705 aa  432  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  37.61 
 
 		 698 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1398  putative DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase [NAD+]) protein  38.67 
 
 		 813 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  38.31 
 
 		 699 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  39.38 
 
 		 687 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0729  DNA ligase, NAD-dependent  39.47 
 
 		 687 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3804  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.85 
 
 		 794 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44660  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.44 
 
 		 794 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139158  normal  0.0637496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3466  DNA ligase, NAD-dependent  36.13 
 
 		 689 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  39.09 
 
 		 687 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.21 
 
 		 776 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.48 
 
 		 786 aa  422  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.51 
 
 		 776 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.4 
 
 		 776 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  48.12 
 
 		 681 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  48.93 
 
 		 718 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3600  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.97 
 
 		 776 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  42.1 
 
 		 677 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2070  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.34 
 
 		 717 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1336  DNA ligase, NAD-dependent  38.01 
 
 		 813 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.528438 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1272  DNA ligase, NAD-dependent  37.89 
 
 		 817 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.229595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  48.73 
 
 		 726 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2876  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.96 
 
 		 719 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0956415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.12 
 
 		 774 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2047  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.82 
 
 		 831 aa  411  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  37.99 
 
 		 672 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2128  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.87 
 
 		 837 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.825717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.81 
 
 		 787 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  36.74 
 
 		 716 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.87 
 
 		 669 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  37.23 
 
 		 714 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0735  DNA ligase, NAD-dependent  38.75 
 
 		 699 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  33.55 
 
 		 664 aa  405  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4642  DNA ligase, NAD-dependent  36.57 
 
 		 814 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  37.47 
 
 		 720 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  49.89 
 
 		 673 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30290  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.17 
 
 		 784 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5183  DNA ligase, NAD-dependent  36.37 
 
 		 814 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3294  DNA ligase, NAD-dependent  36.75 
 
 		 795 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  36.72 
 
 		 714 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0937  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.34 
 
 		 717 aa  401  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0205713  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0491  DNA ligase, NAD-dependent  36.65 
 
 		 829 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.99 
 
 		 669 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3656  DNA ligase, NAD-dependent  36.87 
 
 		 787 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.14 
 
 		 670 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.77 
 
 		 669 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  47.28 
 
 		 708 aa  395  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.26 
 
 		 670 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>