More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_05940 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  52.02 
 
 		 816 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.89 
 
 		 782 aa  769    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  52.78 
 
 		 722 aa  695    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  50.54 
 
 		 824 aa  686    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  51.17 
 
 		 775 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  52.89 
 
 		 688 aa  707    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  49.59 
 
 		 871 aa  688    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  53.08 
 
 		 736 aa  693    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  63.16 
 
 		 770 aa  942    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.32 
 
 		 731 aa  667    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  50.5 
 
 		 749 aa  709    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  50.71 
 
 		 723 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.92 
 
 		 712 aa  734    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 797 aa  1586    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  52.88 
 
 		 691 aa  713    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.12 
 
 		 701 aa  745    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  50.92 
 
 		 716 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  49.88 
 
 		 830 aa  669    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  50.33 
 
 		 726 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  55.31 
 
 		 696 aa  749    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.12 
 
 		 701 aa  745    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  50.46 
 
 		 711 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  53.45 
 
 		 770 aa  721    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  53.35 
 
 		 798 aa  706    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  51.31 
 
 		 732 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.77 
 
 		 731 aa  713    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  65.44 
 
 		 790 aa  943    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  52.69 
 
 		 695 aa  700    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  52.59 
 
 		 752 aa  676    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.12 
 
 		 701 aa  745    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.01 
 
 		 707 aa  735    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  54.71 
 
 		 871 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  51.01 
 
 		 706 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  48.53 
 
 		 703 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  46.06 
 
 		 710 aa  561  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  44.06 
 
 		 705 aa  550  1e-155  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 708 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  44.17 
 
 		 725 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.42 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  53.25 
 
 		 962 aa  492  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  50.27 
 
 		 920 aa  479  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.91 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  41.22 
 
 		 700 aa  465  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.06 
 
 		 776 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3600  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.9 
 
 		 776 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.8 
 
 		 776 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  41.15 
 
 		 711 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.67 
 
 		 776 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  38.63 
 
 		 699 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2579  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.13 
 
 		 718 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1376  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.18 
 
 		 719 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390799  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  39.92 
 
 		 697 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.82 
 
 		 786 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 690 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2840  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.39 
 
 		 718 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229062  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.92 
 
 		 669 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  35.95 
 
 		 665 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1420  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.18 
 
 		 719 aa  452  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.71 
 
 		 721 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  37.83 
 
 		 690 aa  452  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  38.57 
 
 		 669 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.78 
 
 		 670 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  38.25 
 
 		 716 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  38.25 
 
 		 714 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  40.43 
 
 		 670 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1801  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.05 
 
 		 785 aa  446  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0162634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  39.72 
 
 		 698 aa  445  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  37.43 
 
 		 670 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  40.82 
 
 		 672 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.53 
 
 		 681 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.59 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  38.59 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  40.41 
 
 		 671 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1754  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.77 
 
 		 721 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  37.4 
 
 		 672 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  38.59 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.59 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  37.99 
 
 		 674 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3160  DNA ligase, NAD-dependent  39.26 
 
 		 708 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.780726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2070  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.42 
 
 		 717 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  40.42 
 
 		 691 aa  442  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.59 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  37.87 
 
 		 674 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.25 
 
 		 673 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  39.5 
 
 		 673 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0937  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.14 
 
 		 717 aa  439  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0205713  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.32 
 
 		 669 aa  439  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.46 
 
 		 671 aa  437  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  37.55 
 
 		 670 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  38.71 
 
 		 714 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.1 
 
 		 681 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.33 
 
 		 671 aa  436  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.95 
 
 		 671 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  39.53 
 
 		 720 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  39.66 
 
 		 715 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  38.87 
 
 		 672 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  41.11 
 
 		 685 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  35.45 
 
 		 663 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.06 
 
 		 671 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.06 
 
 		 671 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>