More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04740 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  69.14 
 
 
708 aa  996    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  59.74 
 
 
705 aa  827    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  72.84 
 
 
708 aa  1043    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 
725 aa  1475    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  47.35 
 
 
659 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  47.6 
 
 
681 aa  605  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  49.93 
 
 
673 aa  606  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  46.76 
 
 
670 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.97 
 
 
676 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  47.67 
 
 
670 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 
685 aa  591  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  43.46 
 
 
678 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  48.03 
 
 
695 aa  589  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  46.57 
 
 
678 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  49.07 
 
 
675 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  43.58 
 
 
674 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  47.85 
 
 
710 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  43.67 
 
 
674 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.53 
 
 
679 aa  578  1e-164  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  45.11 
 
 
672 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  43.53 
 
 
684 aa  577  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  44.53 
 
 
663 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  47.6 
 
 
673 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  46.22 
 
 
711 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 
683 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  46.1 
 
 
669 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  47.35 
 
 
691 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.95 
 
 
670 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  47.06 
 
 
691 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.9 
 
 
738 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  44.57 
 
 
677 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  45.7 
 
 
691 aa  569  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  47.43 
 
 
711 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  47.06 
 
 
746 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  47.2 
 
 
691 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  47.06 
 
 
691 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  46.06 
 
 
681 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.57 
 
 
670 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.73 
 
 
682 aa  567  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.71 
 
 
670 aa  568  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.9 
 
 
669 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  44.59 
 
 
673 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.57 
 
 
670 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.96 
 
 
684 aa  568  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.83 
 
 
671 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1738  DNA ligase (NAD(+))  45.9 
 
 
670 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000265236  hitchhiker  0.00000000308694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  42.73 
 
 
663 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  47.06 
 
 
691 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  45.53 
 
 
668 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  47.09 
 
 
696 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.96 
 
 
669 aa  568  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.72 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  45.72 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 
670 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.35 
 
 
662 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 
669 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 
669 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 
669 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 
669 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 
669 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.72 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.51 
 
 
681 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  45.72 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  46.77 
 
 
691 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.88 
 
 
670 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.49 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 
669 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  46.87 
 
 
691 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  45.38 
 
 
726 aa  564  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.72 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.72 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.3 
 
 
721 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.72 
 
 
671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.56 
 
 
731 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 
691 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  46.19 
 
 
673 aa  565  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.76 
 
 
671 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.76 
 
 
669 aa  561  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  47.03 
 
 
691 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  46.74 
 
 
691 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  46.74 
 
 
691 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.96 
 
 
680 aa  560  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  46.74 
 
 
691 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  46.74 
 
 
691 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  46.74 
 
 
691 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  45.44 
 
 
690 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.83 
 
 
671 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.38 
 
 
681 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.76 
 
 
671 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  46.74 
 
 
691 aa  561  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 
690 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 
690 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.83 
 
 
671 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.83 
 
 
671 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 
669 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  44.85 
 
 
689 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  46.16 
 
 
671 aa  557  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 
670 aa  555  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  45.26 
 
 
682 aa  557  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2847  DNA ligase, NAD-dependent  44.66 
 
 
670 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000873668  hitchhiker  0.000000438605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>