More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2883 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.3 
 
 		 670 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  53.26 
 
 		 696 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  50 
 
 		 690 aa  691    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  47.68 
 
 		 672 aa  647    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  67.6 
 
 		 676 aa  947    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  64.5 
 
 		 684 aa  897    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  73.59 
 
 		 674 aa  1006    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  50.15 
 
 		 690 aa  695    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.73 
 
 		 680 aa  756    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.03 
 
 		 680 aa  755    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.3 
 
 		 679 aa  851    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.7 
 
 		 670 aa  639    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.66 
 
 		 738 aa  858    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 670 aa  641    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  73.44 
 
 		 674 aa  1001    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.57 
 
 		 774 aa  875    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 678 aa  1395    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.57 
 
 		 697 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  48.13 
 
 		 663 aa  628  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  47.16 
 
 		 663 aa  616  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  46.34 
 
 		 672 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  47.53 
 
 		 662 aa  610  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.82 
 
 		 671 aa  611  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  44.77 
 
 		 673 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  45.25 
 
 		 685 aa  609  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.49 
 
 		 669 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  45.62 
 
 		 668 aa  608  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.72 
 
 		 669 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  46.94 
 
 		 684 aa  606  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.35 
 
 		 669 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.2 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.2 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.2 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.96 
 
 		 669 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.2 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  46.07 
 
 		 683 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  44.53 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  45.64 
 
 		 671 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  47.35 
 
 		 681 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  44.38 
 
 		 671 aa  601  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 671 aa  601  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.81 
 
 		 669 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.23 
 
 		 671 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  46.12 
 
 		 712 aa  599  1e-170  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.05 
 
 		 669 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  45.74 
 
 		 690 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.38 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  46.38 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  44.69 
 
 		 665 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.08 
 
 		 671 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.08 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  46.24 
 
 		 683 aa  598  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.98 
 
 		 670 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  44.18 
 
 		 667 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.13 
 
 		 670 aa  598  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.08 
 
 		 671 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.76 
 
 		 669 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.98 
 
 		 670 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  44.18 
 
 		 667 aa  595  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.08 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.43 
 
 		 670 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  44.36 
 
 		 673 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  45.81 
 
 		 673 aa  594  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 		 688 aa  595  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 		 688 aa  595  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  44.61 
 
 		 659 aa  594  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.69 
 
 		 673 aa  592  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  44.23 
 
 		 677 aa  589  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  45.16 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  46.63 
 
 		 673 aa  591  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 691 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  45.19 
 
 		 675 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.79 
 
 		 671 aa  591  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.57 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 672 aa  588  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 691 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  46.15 
 
 		 677 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  46.04 
 
 		 718 aa  591  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 746 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 691 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  44.73 
 
 		 681 aa  590  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 691 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 691 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  45.16 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  45.01 
 
 		 673 aa  589  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 691 aa  588  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  45.59 
 
 		 678 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  44.85 
 
 		 688 aa  588  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  45.31 
 
 		 691 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  44.87 
 
 		 691 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  45.28 
 
 		 706 aa  588  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.95 
 
 		 673 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  45.52 
 
 		 673 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  45.59 
 
 		 661 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>