More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_29061 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  53.59 
 
 		 684 aa  725    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  54.74 
 
 		 690 aa  796    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  54.01 
 
 		 690 aa  787    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  53.78 
 
 		 676 aa  736    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  65.26 
 
 		 680 aa  902    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  68.8 
 
 		 680 aa  946    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.74 
 
 		 679 aa  813    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  55.03 
 
 		 674 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.9 
 
 		 697 aa  840    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  53.28 
 
 		 678 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  55.03 
 
 		 674 aa  725    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.33 
 
 		 774 aa  723    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 696 aa  1422    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.51 
 
 		 738 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  45.55 
 
 		 672 aa  595  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  44.27 
 
 		 673 aa  586  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  45.1 
 
 		 670 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 670 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  45.11 
 
 		 706 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  43 
 
 		 681 aa  565  1e-160  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  45.19 
 
 		 672 aa  561  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  44.02 
 
 		 673 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  44.54 
 
 		 711 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  45.39 
 
 		 691 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.28 
 
 		 670 aa  555  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  44.67 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 663 aa  555  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  45.24 
 
 		 746 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  45.11 
 
 		 661 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  45.24 
 
 		 691 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.96 
 
 		 691 aa  555  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  44.91 
 
 		 691 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  44.92 
 
 		 707 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  42.98 
 
 		 697 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  42.64 
 
 		 721 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  42.25 
 
 		 670 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  43.18 
 
 		 708 aa  551  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 708 aa  551  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  44.52 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 688 aa  547  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  42.07 
 
 		 688 aa  547  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  43.77 
 
 		 683 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  44.11 
 
 		 673 aa  548  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  42.34 
 
 		 659 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  44.19 
 
 		 673 aa  544  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.19 
 
 		 669 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  43.38 
 
 		 682 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.19 
 
 		 669 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  42.79 
 
 		 690 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.34 
 
 		 669 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.34 
 
 		 669 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.34 
 
 		 669 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.63 
 
 		 670 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.63 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  44.1 
 
 		 675 aa  539  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  42.17 
 
 		 673 aa  539  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.27 
 
 		 669 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  42.4 
 
 		 671 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  44.01 
 
 		 683 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.63 
 
 		 670 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.9 
 
 		 669 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  43.84 
 
 		 678 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.04 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.04 
 
 		 669 aa  538  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.04 
 
 		 669 aa  538  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  41.43 
 
 		 673 aa  535  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.19 
 
 		 669 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.81 
 
 		 673 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  43.74 
 
 		 694 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  41.05 
 
 		 673 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.75 
 
 		 669 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  43.39 
 
 		 691 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  43.58 
 
 		 688 aa  538  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  41.94 
 
 		 670 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  41.16 
 
 		 663 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  41.94 
 
 		 673 aa  537  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 691 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  43.13 
 
 		 684 aa  534  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 670 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 691 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  43.59 
 
 		 690 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.63 
 
 		 677 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  43.98 
 
 		 669 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  42.88 
 
 		 712 aa  534  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  42.57 
 
 		 681 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  41.45 
 
 		 670 aa  531  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  42.38 
 
 		 662 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  44.25 
 
 		 683 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 691 aa  532  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  42.08 
 
 		 672 aa  530  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  42.59 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 688 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.3 
 
 		 673 aa  531  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  41.32 
 
 		 711 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.9 
 
 		 669 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  43.52 
 
 		 691 aa  528  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>