More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2316 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  46.17 
 
 		 690 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.08 
 
 		 676 aa  895    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.93 
 
 		 680 aa  739    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.72 
 
 		 680 aa  737    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.05 
 
 		 679 aa  818    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.58 
 
 		 697 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.2 
 
 		 738 aa  860    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  46.83 
 
 		 690 aa  696    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  56.57 
 
 		 678 aa  875    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 774 aa  1584    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  55.68 
 
 		 684 aa  856    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  56.21 
 
 		 674 aa  851    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  56.21 
 
 		 674 aa  848    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.27 
 
 		 696 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  42.61 
 
 		 672 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.27 
 
 		 670 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  42.21 
 
 		 670 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 673 aa  579  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  41.77 
 
 		 672 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.08 
 
 		 669 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  41.59 
 
 		 688 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.35 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.48 
 
 		 669 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  41.59 
 
 		 688 aa  567  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.48 
 
 		 669 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.48 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.74 
 
 		 669 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.35 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.48 
 
 		 669 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.35 
 
 		 669 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.35 
 
 		 669 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  40.83 
 
 		 670 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.22 
 
 		 669 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  40.84 
 
 		 659 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  41.75 
 
 		 662 aa  559  1e-158  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  39.42 
 
 		 671 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  41.23 
 
 		 683 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  39.87 
 
 		 665 aa  555  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  41.53 
 
 		 671 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  40.85 
 
 		 684 aa  552  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  40.66 
 
 		 672 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  39.19 
 
 		 708 aa  549  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  39.79 
 
 		 667 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  39.79 
 
 		 681 aa  550  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  39.79 
 
 		 667 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.44 
 
 		 721 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  40.29 
 
 		 661 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  41.3 
 
 		 677 aa  552  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  40.44 
 
 		 675 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40.78 
 
 		 711 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  40.03 
 
 		 663 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  40.6 
 
 		 691 aa  548  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  40.21 
 
 		 668 aa  543  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  42.84 
 
 		 663 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  40.24 
 
 		 694 aa  545  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  40.23 
 
 		 706 aa  542  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  38.95 
 
 		 725 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  40.21 
 
 		 673 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  39.39 
 
 		 708 aa  540  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  39.87 
 
 		 678 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  39.3 
 
 		 670 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  39.43 
 
 		 673 aa  538  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  41.37 
 
 		 673 aa  538  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  41.49 
 
 		 666 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  40.05 
 
 		 672 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  40.44 
 
 		 712 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  39.61 
 
 		 685 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.5 
 
 		 690 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.59 
 
 		 648 aa  536  1e-151  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  40.41 
 
 		 681 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  38.15 
 
 		 670 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  40.56 
 
 		 675 aa  533  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  39.74 
 
 		 673 aa  535  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  40.08 
 
 		 726 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  41.37 
 
 		 690 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  41.37 
 
 		 691 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  39.19 
 
 		 680 aa  530  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  39.45 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  39.53 
 
 		 674 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  39.82 
 
 		 664 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  38.29 
 
 		 683 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  39.77 
 
 		 690 aa  528  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  38.72 
 
 		 677 aa  527  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  38.61 
 
 		 673 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  40.21 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.34 
 
 		 670 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  39.84 
 
 		 682 aa  528  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.1 
 
 		 673 aa  526  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.24 
 
 		 670 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  39.97 
 
 		 718 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  39.43 
 
 		 671 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.43 
 
 		 671 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  39.26 
 
 		 669 aa  523  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.43 
 
 		 671 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.43 
 
 		 671 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.11 
 
 		 670 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  38.71 
 
 		 673 aa  523  1e-147  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  39.11 
 
 		 673 aa  525  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.43 
 
 		 671 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  39.06 
 
 		 680 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>