More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0847 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  50.99 
 
 		 673 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  51.44 
 
 		 670 aa  668    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.32 
 
 		 669 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.32 
 
 		 669 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  58.16 
 
 		 668 aa  809    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  48.88 
 
 		 670 aa  638    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  63.14 
 
 		 681 aa  887    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 677 aa  650    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 688 aa  1388    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  53.3 
 
 		 672 aa  711    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  50.08 
 
 		 663 aa  674    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  49.39 
 
 		 684 aa  650    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  50.53 
 
 		 672 aa  649    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 688 aa  1388    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.19 
 
 		 670 aa  655    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.17 
 
 		 669 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  65.15 
 
 		 662 aa  918    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  51.43 
 
 		 662 aa  663    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.13 
 
 		 669 aa  635    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.02 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 669 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 669 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.24 
 
 		 669 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.13 
 
 		 669 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 669 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  50.76 
 
 		 666 aa  628  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.1 
 
 		 670 aa  628  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  47.81 
 
 		 661 aa  624  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  46.75 
 
 		 673 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  46.89 
 
 		 663 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  47.66 
 
 		 659 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  46.17 
 
 		 674 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  46.76 
 
 		 694 aa  611  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  46.17 
 
 		 674 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.5 
 
 		 676 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0592  DNA ligase, NAD-dependent  45.79 
 
 		 669 aa  605  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  46.98 
 
 		 681 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  48.3 
 
 		 718 aa  601  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  46.98 
 
 		 670 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  44.9 
 
 		 665 aa  592  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  46.58 
 
 		 673 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 		 678 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  46.23 
 
 		 668 aa  590  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0947  DNA ligase, NAD-dependent  46.42 
 
 		 675 aa  587  1e-166  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  46.29 
 
 		 671 aa  588  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  44.67 
 
 		 712 aa  585  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.35 
 
 		 679 aa  585  1e-166  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 726 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  45.78 
 
 		 668 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  47.9 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  45.39 
 
 		 671 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  45.72 
 
 		 673 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  45.75 
 
 		 684 aa  585  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  45.2 
 
 		 673 aa  579  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  43.97 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  46.9 
 
 		 672 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  45.64 
 
 		 675 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  46.67 
 
 		 685 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  46.78 
 
 		 704 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.22 
 
 		 738 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  44.68 
 
 		 675 aa  572  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  43.9 
 
 		 680 aa  565  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.59 
 
 		 774 aa  567  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  44.36 
 
 		 678 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21501  NAD-dependent DNA ligase  43.53 
 
 		 690 aa  561  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  43.78 
 
 		 708 aa  559  1e-158  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  45.58 
 
 		 673 aa  559  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  44.3 
 
 		 677 aa  558  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1279  NAD-dependent DNA ligase  43.09 
 
 		 690 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.880494  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.05 
 
 		 680 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.34 
 
 		 680 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.46 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  43.98 
 
 		 675 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  45.74 
 
 		 691 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  45.07 
 
 		 662 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.3 
 
 		 673 aa  556  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  44.15 
 
 		 680 aa  557  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  43.99 
 
 		 683 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.48 
 
 		 670 aa  553  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  42.58 
 
 		 680 aa  553  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.58 
 
 		 648 aa  554  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  43.48 
 
 		 667 aa  550  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 671 aa  548  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  43.15 
 
 		 708 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  44.66 
 
 		 683 aa  544  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  44.16 
 
 		 678 aa  545  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  43.99 
 
 		 697 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  43.26 
 
 		 725 aa  542  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.76 
 
 		 652 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  44.65 
 
 		 683 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.13 
 
 		 697 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.25 
 
 		 691 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  43.22 
 
 		 685 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29061  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.22 
 
 		 696 aa  538  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  42.56 
 
 		 682 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  43.52 
 
 		 685 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>