More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4656 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  49.62 
 
 		 670 aa  648    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  52.48 
 
 		 672 aa  687    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  50.36 
 
 		 711 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.85 
 
 		 679 aa  639    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  51.2 
 
 		 666 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  49.33 
 
 		 662 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.57 
 
 		 670 aa  636    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 673 aa  1370    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  50.96 
 
 		 673 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  51.87 
 
 		 670 aa  657    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.65 
 
 		 676 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  50 
 
 		 670 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  48.58 
 
 		 663 aa  632  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  48.81 
 
 		 683 aa  631  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  48 
 
 		 684 aa  625  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  48.97 
 
 		 691 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  49.48 
 
 		 672 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  49.25 
 
 		 672 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  49.93 
 
 		 673 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  48.84 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  47.91 
 
 		 671 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  49.35 
 
 		 706 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  48.55 
 
 		 746 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  48.7 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  48.99 
 
 		 691 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  48.7 
 
 		 691 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 691 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  48.88 
 
 		 683 aa  621  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  49.93 
 
 		 690 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  48.49 
 
 		 674 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 691 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  48.59 
 
 		 721 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  48.55 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  48.55 
 
 		 691 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  46.55 
 
 		 659 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  48.84 
 
 		 707 aa  617  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  47.9 
 
 		 677 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.84 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  47.99 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.84 
 
 		 671 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  47.84 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  47.94 
 
 		 688 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.99 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.99 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  44.77 
 
 		 678 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  48.09 
 
 		 688 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  49.26 
 
 		 675 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.84 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  47.76 
 
 		 670 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  49.56 
 
 		 707 aa  610  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  49.71 
 
 		 694 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.84 
 
 		 671 aa  611  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  49.4 
 
 		 685 aa  611  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  49.11 
 
 		 703 aa  611  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.5 
 
 		 669 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  48.01 
 
 		 697 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.5 
 
 		 669 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  46.46 
 
 		 673 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  50.6 
 
 		 693 aa  606  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  46.06 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.17 
 
 		 671 aa  605  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.35 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.35 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.35 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2841  DNA ligase, NAD-dependent  47.04 
 
 		 732 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  47.31 
 
 		 668 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1812  DNA ligase (NAD+)  50.07 
 
 		 677 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.35 
 
 		 669 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.35 
 
 		 669 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.2 
 
 		 669 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  46.7 
 
 		 671 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  46.12 
 
 		 684 aa  600  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  48.5 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.05 
 
 		 669 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.05 
 
 		 669 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  45.19 
 
 		 674 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  48.04 
 
 		 691 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  47.9 
 
 		 671 aa  595  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  45.04 
 
 		 674 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.54 
 
 		 669 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.16 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.09 
 
 		 671 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.01 
 
 		 671 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  48.58 
 
 		 686 aa  595  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4463  DNA ligase, NAD-dependent  47.81 
 
 		 693 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0518609  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  47.21 
 
 		 726 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.94 
 
 		 671 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  47.64 
 
 		 681 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 662 aa  594  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.09 
 
 		 671 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  47.16 
 
 		 668 aa  595  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.81 
 
 		 670 aa  591  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.67 
 
 		 670 aa  588  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  45.72 
 
 		 688 aa  589  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.89 
 
 		 680 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>