More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1993 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.48 
 
 		 670 aa  822    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  82.5 
 
 		 665 aa  1155    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.36 
 
 		 669 aa  830    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  50.46 
 
 		 672 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.76 
 
 		 669 aa  833    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.68 
 
 		 652 aa  668    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  48.18 
 
 		 663 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.51 
 
 		 669 aa  832    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.67 
 
 		 669 aa  832    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.67 
 
 		 669 aa  832    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.76 
 
 		 669 aa  832    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  49.77 
 
 		 677 aa  659    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  50.08 
 
 		 673 aa  676    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.51 
 
 		 669 aa  832    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 667 aa  1373    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  52.64 
 
 		 684 aa  711    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  51.8 
 
 		 670 aa  696    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  51.07 
 
 		 666 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  62.56 
 
 		 670 aa  867    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.76 
 
 		 669 aa  830    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  51.52 
 
 		 662 aa  666    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.45 
 
 		 669 aa  828    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  51.52 
 
 		 680 aa  702    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 		 659 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.45 
 
 		 669 aa  832    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0472  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.12 
 
 		 686 aa  659    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  49.32 
 
 		 668 aa  651    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0568  NAD-dependent DNA ligase  50.45 
 
 		 680 aa  667    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.76 
 
 		 648 aa  684    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.6 
 
 		 669 aa  838    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 667 aa  1373    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  47.88 
 
 		 663 aa  631  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  47.82 
 
 		 690 aa  628  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  48.17 
 
 		 670 aa  627  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  47.87 
 
 		 672 aa  625  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0427  NAD-dependent DNA ligase  46.69 
 
 		 684 aa  619  1e-176  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  46.92 
 
 		 683 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  46.59 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.93 
 
 		 670 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  46.36 
 
 		 746 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  46.51 
 
 		 691 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  46.73 
 
 		 691 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  46.36 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  46.36 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  46.21 
 
 		 691 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  46.36 
 
 		 691 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  45.69 
 
 		 671 aa  608  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  46.74 
 
 		 661 aa  608  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  46.2 
 
 		 688 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.15 
 
 		 676 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.93 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  44.74 
 
 		 668 aa  604  1.0000000000000001e-171  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  46.05 
 
 		 688 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  44.71 
 
 		 662 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  44.44 
 
 		 711 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  44.18 
 
 		 678 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  46.17 
 
 		 690 aa  595  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  46.32 
 
 		 690 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  46.32 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  45.85 
 
 		 672 aa  596  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  46.04 
 
 		 689 aa  593  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.93 
 
 		 673 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  44.21 
 
 		 673 aa  594  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  46.45 
 
 		 681 aa  592  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  45.73 
 
 		 685 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 		 674 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 673 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 688 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 688 aa  587  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  46.39 
 
 		 675 aa  588  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 		 685 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  45.62 
 
 		 675 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  44.73 
 
 		 684 aa  587  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  44.83 
 
 		 674 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  44.06 
 
 		 670 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  44.43 
 
 		 668 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  45.3 
 
 		 685 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 669 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  45.3 
 
 		 685 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  44.58 
 
 		 668 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  43.54 
 
 		 670 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  43.78 
 
 		 708 aa  578  1e-164  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  43.01 
 
 		 681 aa  580  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  45.67 
 
 		 674 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  43.32 
 
 		 721 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.68 
 
 		 671 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 671 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.21 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.68 
 
 		 671 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.93 
 
 		 683 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.11 
 
 		 669 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.63 
 
 		 673 aa  577  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>