More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26670 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  69.14 
 
 		 725 aa  985    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  48.46 
 
 		 670 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 708 aa  1449    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  59.91 
 
 		 705 aa  835    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  72.04 
 
 		 708 aa  1042    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  48.02 
 
 		 659 aa  627  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  49.56 
 
 		 673 aa  605  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  49.2 
 
 		 675 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  47.17 
 
 		 678 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  48.13 
 
 		 695 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.12 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.12 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  48.98 
 
 		 691 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.12 
 
 		 671 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 663 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  47.6 
 
 		 681 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  48.06 
 
 		 711 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.12 
 
 		 671 aa  595  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.97 
 
 		 671 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  46.71 
 
 		 670 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  46.99 
 
 		 672 aa  591  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  47.02 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.17 
 
 		 671 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  47.17 
 
 		 671 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.17 
 
 		 671 aa  586  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  46.44 
 
 		 673 aa  588  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.02 
 
 		 671 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  43.96 
 
 		 678 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.87 
 
 		 671 aa  588  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.01 
 
 		 676 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  47.17 
 
 		 671 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.17 
 
 		 671 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  46.7 
 
 		 668 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.51 
 
 		 670 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.02 
 
 		 671 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  45.4 
 
 		 662 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.02 
 
 		 671 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.36 
 
 		 673 aa  584  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.44 
 
 		 738 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  43.78 
 
 		 667 aa  578  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.84 
 
 		 681 aa  580  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  45.41 
 
 		 677 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.76 
 
 		 670 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.84 
 
 		 670 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  47.59 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  43.78 
 
 		 667 aa  578  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.84 
 
 		 670 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  44.48 
 
 		 674 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  47.32 
 
 		 696 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.35 
 
 		 670 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  46.47 
 
 		 668 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  48.9 
 
 		 685 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  47.25 
 
 		 681 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  44.63 
 
 		 674 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  43.59 
 
 		 665 aa  575  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  44.38 
 
 		 663 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.74 
 
 		 669 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  45.52 
 
 		 671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  46.45 
 
 		 697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.13 
 
 		 681 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  45.87 
 
 		 707 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  44.09 
 
 		 684 aa  568  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 669 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  44.1 
 
 		 690 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  45.68 
 
 		 690 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  45.99 
 
 		 674 aa  572  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  44.29 
 
 		 706 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  47.14 
 
 		 746 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  47.94 
 
 		 683 aa  572  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  47.14 
 
 		 691 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  47.14 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  45.45 
 
 		 691 aa  569  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.51 
 
 		 669 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  47.68 
 
 		 673 aa  567  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.51 
 
 		 669 aa  568  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.22 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.22 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.07 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  46.43 
 
 		 691 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  46.91 
 
 		 682 aa  568  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.65 
 
 		 679 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.89 
 
 		 673 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  43.27 
 
 		 673 aa  567  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.83 
 
 		 731 aa  567  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  47.01 
 
 		 712 aa  566  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  43.42 
 
 		 670 aa  567  1e-160  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.22 
 
 		 669 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  45.32 
 
 		 669 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.22 
 
 		 690 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  45.52 
 
 		 672 aa  568  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  46.18 
 
 		 661 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 		 726 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  47.1 
 
 		 710 aa  566  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  47 
 
 		 691 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  47.14 
 
 		 691 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.4 
 
 		 683 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  45.14 
 
 		 685 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>