More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1111 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 705 aa  1447    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  59.74 
 
 		 725 aa  813    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  59.91 
 
 		 708 aa  835    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  63.53 
 
 		 708 aa  876    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  48.71 
 
 		 672 aa  630  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 659 aa  601  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  46.14 
 
 		 670 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.3 
 
 		 663 aa  591  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.83 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  48.37 
 
 		 746 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  48.5 
 
 		 691 aa  591  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  48.37 
 
 		 691 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.26 
 
 		 670 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  48.55 
 
 		 691 aa  588  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  47.04 
 
 		 681 aa  586  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  47 
 
 		 673 aa  585  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  48.23 
 
 		 691 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  48.23 
 
 		 691 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  46.39 
 
 		 695 aa  586  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  48.23 
 
 		 691 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  48.23 
 
 		 691 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.91 
 
 		 676 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  46.16 
 
 		 678 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.65 
 
 		 679 aa  574  1.0000000000000001e-162  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  46.36 
 
 		 718 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  46.99 
 
 		 683 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  46.32 
 
 		 703 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  46.65 
 
 		 691 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  46.65 
 
 		 691 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  46.9 
 
 		 710 aa  571  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  46.65 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  46.65 
 
 		 691 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  46.65 
 
 		 691 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  46.53 
 
 		 688 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  46.79 
 
 		 691 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  46.65 
 
 		 691 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  45.74 
 
 		 683 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  45.87 
 
 		 691 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  46.55 
 
 		 688 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  45.88 
 
 		 726 aa  568  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  44.19 
 
 		 684 aa  566  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  45.9 
 
 		 722 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  44.17 
 
 		 677 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  44.54 
 
 		 703 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  46.14 
 
 		 732 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.86 
 
 		 680 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  46.22 
 
 		 736 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  45.75 
 
 		 675 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.43 
 
 		 738 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  44.48 
 
 		 712 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  43.46 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  43.59 
 
 		 770 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.04 
 
 		 680 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 667 aa  558  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  44.24 
 
 		 673 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 667 aa  558  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  43.46 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  44.81 
 
 		 668 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  46.55 
 
 		 685 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  43.65 
 
 		 672 aa  552  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  42.73 
 
 		 665 aa  555  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.08 
 
 		 669 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  45.4 
 
 		 711 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  42.78 
 
 		 675 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  43.17 
 
 		 674 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  44.57 
 
 		 670 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.75 
 
 		 673 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  42.53 
 
 		 662 aa  553  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.89 
 
 		 648 aa  554  1e-156  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  46.4 
 
 		 673 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.64 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.64 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.64 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.5 
 
 		 669 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.08 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  44.54 
 
 		 673 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.64 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  44.33 
 
 		 697 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  45.31 
 
 		 711 aa  551  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 666 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  44.64 
 
 		 690 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  44.06 
 
 		 797 aa  550  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  43.47 
 
 		 674 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  45.21 
 
 		 726 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.5 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.29 
 
 		 731 aa  547  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.88 
 
 		 670 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  43.59 
 
 		 680 aa  548  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.98 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.98 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  44.65 
 
 		 672 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  44.13 
 
 		 668 aa  548  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.79 
 
 		 669 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.21 
 
 		 669 aa  545  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  44.72 
 
 		 664 aa  546  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.21 
 
 		 669 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.59 
 
 		 652 aa  544  1e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  44.96 
 
 		 696 aa  544  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  44.85 
 
 		 674 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.53 
 
 		 701 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>