More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2205 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  63.53 
 
 		 705 aa  876    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  72.84 
 
 		 725 aa  1031    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  72.04 
 
 		 708 aa  1042    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 708 aa  1429    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  47.03 
 
 		 670 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  50.65 
 
 		 673 aa  605  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  48.48 
 
 		 681 aa  608  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.25 
 
 		 676 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  49.57 
 
 		 710 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  48.31 
 
 		 672 aa  598  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  48.73 
 
 		 703 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  47 
 
 		 659 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  49.49 
 
 		 711 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  48.07 
 
 		 695 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.73 
 
 		 738 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.69 
 
 		 679 aa  590  1e-167  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  47.49 
 
 		 726 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  46.85 
 
 		 670 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  47.14 
 
 		 718 aa  585  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  48.34 
 
 		 716 aa  585  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  47.93 
 
 		 711 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  45.04 
 
 		 684 aa  585  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  48.84 
 
 		 691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  48.42 
 
 		 697 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.44 
 
 		 663 aa  582  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  45.32 
 
 		 674 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  47.94 
 
 		 706 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  47.14 
 
 		 661 aa  580  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  47.4 
 
 		 678 aa  580  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.11 
 
 		 680 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  45.02 
 
 		 674 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  49.42 
 
 		 685 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.07 
 
 		 671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  47.07 
 
 		 671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.07 
 
 		 671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.07 
 
 		 671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  47.07 
 
 		 671 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  47.34 
 
 		 690 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  47.65 
 
 		 707 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  47.71 
 
 		 722 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  47.83 
 
 		 696 aa  575  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  48.54 
 
 		 675 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.92 
 
 		 671 aa  571  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 663 aa  570  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.9 
 
 		 731 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.1 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.18 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.92 
 
 		 671 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.1 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  47.38 
 
 		 682 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.92 
 
 		 671 aa  570  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.1 
 
 		 701 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  43.47 
 
 		 667 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.36 
 
 		 662 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  46.07 
 
 		 706 aa  568  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.77 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  46.31 
 
 		 721 aa  568  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  45.63 
 
 		 673 aa  566  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  43.47 
 
 		 667 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  46.3 
 
 		 683 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  44.96 
 
 		 677 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 665 aa  565  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  42.05 
 
 		 678 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  45.86 
 
 		 685 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.29 
 
 		 670 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  48.97 
 
 		 673 aa  560  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  46.4 
 
 		 669 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  45.51 
 
 		 673 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.75 
 
 		 670 aa  561  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  44.98 
 
 		 684 aa  558  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 669 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 669 aa  557  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 669 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  45.17 
 
 		 673 aa  557  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  45.26 
 
 		 668 aa  557  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 		 672 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 669 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 		 669 aa  558  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 669 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  47.15 
 
 		 666 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  46.44 
 
 		 694 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  45.99 
 
 		 674 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  46.99 
 
 		 694 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.76 
 
 		 669 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.32 
 
 		 669 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.22 
 
 		 670 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.97 
 
 		 670 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.6 
 
 		 684 aa  552  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  45.79 
 
 		 691 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.23 
 
 		 680 aa  553  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  46.79 
 
 		 664 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  47.2 
 
 		 816 aa  555  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  44.88 
 
 		 668 aa  555  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.2 
 
 		 673 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  45.6 
 
 		 673 aa  552  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.61 
 
 		 669 aa  553  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  45.1 
 
 		 749 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  45.65 
 
 		 711 aa  549  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>