More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0694 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  67.05 
 
 		 710 aa  917    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  59.92 
 
 		 775 aa  821    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  63.81 
 
 		 722 aa  878    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  64.47 
 
 		 696 aa  891    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  56.21 
 
 		 770 aa  768    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  65 
 
 		 712 aa  870    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  56.22 
 
 		 749 aa  784    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  63.24 
 
 		 731 aa  841    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  52.4 
 
 		 798 aa  681    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  58.21 
 
 		 871 aa  676    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  66.23 
 
 		 701 aa  885    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  62.24 
 
 		 816 aa  830    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  62.87 
 
 		 691 aa  863    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  65.24 
 
 		 691 aa  878    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  63.33 
 
 		 732 aa  842    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  63.62 
 
 		 688 aa  861    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  64.29 
 
 		 706 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  65.89 
 
 		 711 aa  907    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  65.84 
 
 		 703 aa  876    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  67.2 
 
 		 731 aa  910    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  66.23 
 
 		 701 aa  885    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.63 
 
 		 782 aa  757    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  58.31 
 
 		 723 aa  790    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  59.56 
 
 		 726 aa  784    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  64.11 
 
 		 736 aa  846    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  52.69 
 
 		 797 aa  700    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  58.92 
 
 		 790 aa  788    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  67.65 
 
 		 716 aa  899    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  60.56 
 
 		 770 aa  829    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 695 aa  1400    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  59.83 
 
 		 752 aa  773    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  66.23 
 
 		 701 aa  885    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  65.41 
 
 		 707 aa  887    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  50.59 
 
 		 681 aa  632  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  47.07 
 
 		 871 aa  623  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  50.22 
 
 		 718 aa  621  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  49.18 
 
 		 672 aa  615  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  49.05 
 
 		 726 aa  611  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  48.14 
 
 		 683 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  48.13 
 
 		 708 aa  600  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.9 
 
 		 670 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.63 
 
 		 670 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  48.07 
 
 		 708 aa  593  1e-168  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  49.41 
 
 		 712 aa  592  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  47.69 
 
 		 671 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  48.81 
 
 		 666 aa  588  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  46.39 
 
 		 705 aa  586  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  48.06 
 
 		 671 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  46.47 
 
 		 670 aa  582  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  46.04 
 
 		 830 aa  581  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 673 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  48.03 
 
 		 725 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  47.85 
 
 		 685 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  47.16 
 
 		 670 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  46.76 
 
 		 677 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  47.4 
 
 		 670 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  47.54 
 
 		 672 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  46.12 
 
 		 668 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  46.65 
 
 		 663 aa  565  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.42 
 
 		 671 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.42 
 
 		 671 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  47.39 
 
 		 691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  46.42 
 
 		 671 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.18 
 
 		 671 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  45.36 
 
 		 673 aa  564  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  46.42 
 
 		 671 aa  561  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.42 
 
 		 671 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  45.01 
 
 		 673 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 670 aa  559  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  43.36 
 
 		 677 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.27 
 
 		 671 aa  559  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.88 
 
 		 671 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.12 
 
 		 671 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.73 
 
 		 671 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  46.75 
 
 		 691 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  45.67 
 
 		 668 aa  557  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.88 
 
 		 671 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.88 
 
 		 671 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.88 
 
 		 671 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  45.81 
 
 		 711 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  45.54 
 
 		 675 aa  555  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  46.22 
 
 		 690 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 746 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  46.67 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.3 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.44 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.44 
 
 		 670 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 669 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  46.38 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  46.94 
 
 		 675 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  46.38 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  44.74 
 
 		 674 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  46.2 
 
 		 706 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  45.82 
 
 		 672 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  45.36 
 
 		 659 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.99 
 
 		 681 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.44 
 
 		 670 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  45.75 
 
 		 673 aa  550  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>