More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4515 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 726 aa  1463    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  56.57 
 
 		 673 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  50.22 
 
 		 670 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  87.34 
 
 		 718 aa  1203    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  55.08 
 
 		 712 aa  718    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.12 
 
 		 670 aa  639    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.14 
 
 		 670 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 		 677 aa  643    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  52.77 
 
 		 672 aa  695    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  67.06 
 
 		 681 aa  942    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  48.46 
 
 		 670 aa  649    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  50.43 
 
 		 697 aa  633  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  51.1 
 
 		 666 aa  631  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  48.97 
 
 		 683 aa  631  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  50.58 
 
 		 673 aa  628  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 691 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  49.05 
 
 		 695 aa  625  1e-178  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  51.47 
 
 		 672 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  46.7 
 
 		 663 aa  625  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  47.91 
 
 		 662 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  50.07 
 
 		 675 aa  621  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  48.41 
 
 		 670 aa  616  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  49.11 
 
 		 675 aa  616  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  48.11 
 
 		 671 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  48.76 
 
 		 671 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 		 673 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  49.56 
 
 		 685 aa  613  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  46.41 
 
 		 663 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  48.13 
 
 		 711 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.42 
 
 		 669 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 694 aa  611  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.28 
 
 		 669 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.42 
 
 		 669 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.42 
 
 		 669 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.28 
 
 		 669 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.42 
 
 		 669 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.57 
 
 		 669 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  45.04 
 
 		 681 aa  605  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.28 
 
 		 669 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.38 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  47.52 
 
 		 671 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.52 
 
 		 671 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.38 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  47.38 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  50.59 
 
 		 693 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.13 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.13 
 
 		 669 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  48.47 
 
 		 690 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 688 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  47.43 
 
 		 721 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.38 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  46.59 
 
 		 680 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.99 
 
 		 669 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 688 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  47.16 
 
 		 677 aa  601  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.23 
 
 		 671 aa  601  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  47.49 
 
 		 708 aa  601  1e-170  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  46.27 
 
 		 703 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.08 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  47.43 
 
 		 678 aa  601  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  46.95 
 
 		 668 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  47.02 
 
 		 680 aa  600  1e-170  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.66 
 
 		 676 aa  598  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  46.8 
 
 		 668 aa  598  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  47.5 
 
 		 706 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.88 
 
 		 681 aa  597  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  47.21 
 
 		 673 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.95 
 
 		 681 aa  598  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  46.26 
 
 		 674 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  47.4 
 
 		 672 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 662 aa  592  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  46.41 
 
 		 674 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  46.62 
 
 		 659 aa  595  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  47.59 
 
 		 707 aa  595  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  46.89 
 
 		 706 aa  594  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  45.63 
 
 		 678 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.35 
 
 		 670 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  45.28 
 
 		 673 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  49.57 
 
 		 683 aa  591  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.8 
 
 		 673 aa  589  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.2 
 
 		 670 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  48.03 
 
 		 714 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  46.86 
 
 		 674 aa  591  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.2 
 
 		 670 aa  591  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  46.91 
 
 		 707 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.01 
 
 		 671 aa  590  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  45.26 
 
 		 690 aa  591  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  48.9 
 
 		 685 aa  588  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  44.67 
 
 		 673 aa  588  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1370  DNA ligase, NAD-dependent  48.33 
 
 		 684 aa  587  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  46.27 
 
 		 671 aa  585  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  44.99 
 
 		 673 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.73 
 
 		 684 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.78 
 
 		 671 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  44.03 
 
 		 704 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.93 
 
 		 671 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.51 
 
 		 673 aa  582  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  45.39 
 
 		 661 aa  584  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.92 
 
 		 671 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  48.24 
 
 		 715 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>