More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1370 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1370  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 
684 aa  1374    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  48.09 
 
 
681 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  49.06 
 
 
718 aa  602  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  48.33 
 
 
726 aa  588  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 
685 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  49.4 
 
 
712 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  46.8 
 
 
672 aa  571  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2841  DNA ligase, NAD-dependent  47.62 
 
 
732 aa  569  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  46.66 
 
 
673 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  49.48 
 
 
675 aa  568  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  48.24 
 
 
707 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  47.81 
 
 
711 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  46.88 
 
 
683 aa  556  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  47.56 
 
 
690 aa  556  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 
706 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  46.66 
 
 
721 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  45.96 
 
 
670 aa  558  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  47.23 
 
 
703 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.1 
 
 
669 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  45.65 
 
 
666 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1672  DNA ligase, NAD-dependent  46.4 
 
 
740 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.672303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  44.46 
 
 
677 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  48.49 
 
 
693 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  47.08 
 
 
673 aa  545  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  46 
 
 
691 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  46.41 
 
 
693 aa  547  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  45.7 
 
 
688 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  46.58 
 
 
697 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2083  DNA ligase, NAD-dependent  46.05 
 
 
731 aa  546  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0521924  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  46.93 
 
 
672 aa  548  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.56 
 
 
673 aa  547  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  46.58 
 
 
678 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  45.25 
 
 
688 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4463  DNA ligase, NAD-dependent  46.75 
 
 
693 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0518609  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.8 
 
 
669 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  46.06 
 
 
691 aa  545  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  45.85 
 
 
746 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  45.83 
 
 
691 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.56 
 
 
683 aa  545  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  45.83 
 
 
691 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  45.85 
 
 
691 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  46.12 
 
 
694 aa  545  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.8 
 
 
669 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.65 
 
 
669 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.65 
 
 
669 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.5 
 
 
669 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 
691 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.65 
 
 
669 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  45.71 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.65 
 
 
669 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.35 
 
 
669 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  45.41 
 
 
691 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  46.49 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.35 
 
 
669 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  45.64 
 
 
708 aa  541  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  42.19 
 
 
663 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 
691 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 
691 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.98 
 
 
670 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.59 
 
 
670 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  46.53 
 
 
673 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  44.44 
 
 
668 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  45.36 
 
 
671 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  44.54 
 
 
695 aa  535  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  44.03 
 
 
690 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 
671 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  43.77 
 
 
671 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.26 
 
 
670 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.75 
 
 
669 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  43.77 
 
 
671 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 
671 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  47.27 
 
 
683 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.92 
 
 
671 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.92 
 
 
671 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.03 
 
 
671 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.96 
 
 
670 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 
671 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.18 
 
 
670 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.41 
 
 
673 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.43 
 
 
669 aa  528  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.98 
 
 
668 aa  528  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  44.03 
 
 
677 aa  525  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  43.73 
 
 
680 aa  525  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.18 
 
 
670 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1812  DNA ligase (NAD+)  47.03 
 
 
677 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  43.69 
 
 
674 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 
681 aa  524  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.18 
 
 
670 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  44.65 
 
 
680 aa  525  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.67 
 
 
669 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  41.73 
 
 
678 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  45.07 
 
 
671 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  46.27 
 
 
686 aa  521  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  45.59 
 
 
671 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 
703 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.95 
 
 
681 aa  519  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>