More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2927 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.1 
 
 		 671 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  49.1 
 
 		 671 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  51.19 
 
 		 691 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  65.37 
 
 		 670 aa  869    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.1 
 
 		 671 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  54.07 
 
 		 673 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.47 
 
 		 670 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  48.21 
 
 		 670 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  49.55 
 
 		 673 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.15 
 
 		 673 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  52.57 
 
 		 683 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  51.48 
 
 		 683 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  51.17 
 
 		 711 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  50.86 
 
 		 707 aa  651    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  51.49 
 
 		 686 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  50.37 
 
 		 691 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  50.6 
 
 		 675 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.3 
 
 		 670 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  52.37 
 
 		 678 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  58.02 
 
 		 671 aa  748    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  50.82 
 
 		 691 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.7 
 
 		 671 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  64.21 
 
 		 671 aa  870    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  52.44 
 
 		 697 aa  653    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  49.38 
 
 		 672 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  48.64 
 
 		 690 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  53.53 
 
 		 666 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  50.52 
 
 		 691 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  63.5 
 
 		 668 aa  850    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.1 
 
 		 671 aa  640    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.55 
 
 		 671 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.1 
 
 		 671 aa  640    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  51.26 
 
 		 690 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  50.45 
 
 		 674 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  52.91 
 
 		 706 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  51.2 
 
 		 688 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  51.5 
 
 		 670 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.17 
 
 		 670 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  51.19 
 
 		 691 aa  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  63.7 
 
 		 672 aa  848    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.17 
 
 		 670 aa  640    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  50.92 
 
 		 721 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.32 
 
 		 671 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  50.6 
 
 		 670 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  50.37 
 
 		 746 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.62 
 
 		 671 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.55 
 
 		 671 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  49.1 
 
 		 671 aa  640    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  51.04 
 
 		 675 aa  652    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  50.38 
 
 		 673 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  54.77 
 
 		 693 aa  665    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  52.47 
 
 		 673 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  50.67 
 
 		 691 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.95 
 
 		 671 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  63.04 
 
 		 668 aa  846    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  50.67 
 
 		 691 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  48.44 
 
 		 673 aa  650    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  50.57 
 
 		 711 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  50.61 
 
 		 671 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 671 aa  641    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.1 
 
 		 671 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  50.37 
 
 		 691 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 694 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.44 
 
 		 671 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 688 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  54.27 
 
 		 672 aa  698    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  51.69 
 
 		 694 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  50.91 
 
 		 677 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 683 aa  1379    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.18 
 
 		 681 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  50.23 
 
 		 671 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  50.52 
 
 		 691 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  48.94 
 
 		 673 aa  629  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  50.52 
 
 		 691 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.89 
 
 		 681 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.62 
 
 		 670 aa  628  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  50.52 
 
 		 691 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  50.52 
 
 		 691 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  50.23 
 
 		 671 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  50.67 
 
 		 691 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  50.52 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  48.9 
 
 		 707 aa  627  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  50.52 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  48.56 
 
 		 662 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.96 
 
 		 669 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.43 
 
 		 669 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  47.58 
 
 		 689 aa  620  1e-176  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.43 
 
 		 669 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.43 
 
 		 669 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.43 
 
 		 669 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  48.97 
 
 		 726 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.43 
 
 		 669 aa  619  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  47.07 
 
 		 663 aa  619  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.43 
 
 		 669 aa  620  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 		 681 aa  620  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.43 
 
 		 669 aa  619  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4463  DNA ligase, NAD-dependent  49.85 
 
 		 693 aa  621  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0518609  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.29 
 
 		 682 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  50.22 
 
 		 678 aa  621  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.28 
 
 		 669 aa  619  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>