More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1428 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 683 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  52.9 
 
 		 670 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  52.27 
 
 		 673 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  51.12 
 
 		 668 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  49.7 
 
 		 671 aa  639    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  52.44 
 
 		 672 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  52.01 
 
 		 675 aa  644    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  51.56 
 
 		 671 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  50.6 
 
 		 662 aa  668    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  49.63 
 
 		 670 aa  659    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.07 
 
 		 670 aa  643    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  50.37 
 
 		 672 aa  640    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  50.67 
 
 		 668 aa  647    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  50.96 
 
 		 682 aa  636    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 694 aa  1407    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  48.04 
 
 		 672 aa  630  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  51.71 
 
 		 685 aa  629  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  49.33 
 
 		 670 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  48.79 
 
 		 663 aa  625  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  48.42 
 
 		 673 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  49.7 
 
 		 675 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  47.97 
 
 		 673 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  46.53 
 
 		 663 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.74 
 
 		 671 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.74 
 
 		 671 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  51.81 
 
 		 673 aa  618  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 683 aa  618  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.59 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  48.59 
 
 		 671 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.59 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 673 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  48.59 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.59 
 
 		 671 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.59 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.07 
 
 		 670 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  47.46 
 
 		 673 aa  609  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  49.12 
 
 		 712 aa  609  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  48.9 
 
 		 691 aa  609  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  48.32 
 
 		 691 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  46.76 
 
 		 688 aa  611  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  46.76 
 
 		 688 aa  611  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.85 
 
 		 669 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  49.71 
 
 		 711 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.85 
 
 		 669 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  49.33 
 
 		 691 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.44 
 
 		 671 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  47.23 
 
 		 677 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  48.68 
 
 		 691 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.44 
 
 		 671 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  48.32 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.14 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  48.51 
 
 		 681 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  49.71 
 
 		 683 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.7 
 
 		 669 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.21 
 
 		 671 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  48.61 
 
 		 691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  49.7 
 
 		 707 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  48.53 
 
 		 693 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  48.45 
 
 		 721 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  48.46 
 
 		 746 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  47.01 
 
 		 670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  48.46 
 
 		 691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.21 
 
 		 671 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  48.96 
 
 		 718 aa  601  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.7 
 
 		 669 aa  602  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.7 
 
 		 669 aa  602  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 691 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  48.67 
 
 		 688 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 691 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 691 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.62 
 
 		 669 aa  602  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.4 
 
 		 669 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 691 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  47.04 
 
 		 684 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  48.38 
 
 		 726 aa  598  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.4 
 
 		 669 aa  599  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  48.6 
 
 		 691 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 		 694 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 669 aa  598  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  49.55 
 
 		 697 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  46.32 
 
 		 690 aa  598  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  49.78 
 
 		 686 aa  596  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  48.89 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  47.48 
 
 		 706 aa  595  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.4 
 
 		 669 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  49.55 
 
 		 673 aa  597  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  49.48 
 
 		 671 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  47.53 
 
 		 661 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.4 
 
 		 669 aa  598  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  48.05 
 
 		 674 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  48.82 
 
 		 688 aa  595  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  48.5 
 
 		 672 aa  595  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.16 
 
 		 671 aa  595  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.73 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  46.39 
 
 		 659 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  50.46 
 
 		 693 aa  592  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.73 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>