More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18930 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  48.07 
 
 		 722 aa  677    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  48.14 
 
 		 770 aa  687    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  48.06 
 
 		 732 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  46.66 
 
 		 775 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.19 
 
 		 782 aa  737    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  45.02 
 
 		 871 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 871 aa  1749    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  50.24 
 
 		 798 aa  692    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  49.54 
 
 		 797 aa  690    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  50.24 
 
 		 790 aa  732    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  54.63 
 
 		 830 aa  811    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  45.53 
 
 		 723 aa  626  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  47.07 
 
 		 695 aa  624  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  45.45 
 
 		 749 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.07 
 
 		 731 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  41.21 
 
 		 962 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  44.9 
 
 		 816 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.47 
 
 		 731 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  45.48 
 
 		 726 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  54.6 
 
 		 696 aa  506  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  51.25 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  52.38 
 
 		 770 aa  490  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  52.49 
 
 		 716 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  50.81 
 
 		 710 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  52.8 
 
 		 712 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.63 
 
 		 701 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.63 
 
 		 701 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.63 
 
 		 701 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  53.37 
 
 		 707 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  50.29 
 
 		 691 aa  482  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  53.11 
 
 		 736 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  51.75 
 
 		 688 aa  479  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  53.86 
 
 		 703 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.71 
 
 		 691 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  52.93 
 
 		 824 aa  462  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  51.89 
 
 		 706 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  42.94 
 
 		 920 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  51.1 
 
 		 752 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.82 
 
 		 776 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.7 
 
 		 776 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  36 
 
 		 677 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  35.41 
 
 		 670 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.82 
 
 		 776 aa  399  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.92 
 
 		 787 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  45.81 
 
 		 708 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  33.71 
 
 		 674 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  33.83 
 
 		 674 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  34.89 
 
 		 662 aa  379  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.47 
 
 		 669 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.23 
 
 		 669 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.23 
 
 		 669 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.23 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3804  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.28 
 
 		 794 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.23 
 
 		 669 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.35 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.23 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44660  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.32 
 
 		 794 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139158  normal  0.0637496 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  43.22 
 
 		 708 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.86 
 
 		 670 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  42.27 
 
 		 726 aa  364  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  33.25 
 
 		 673 aa  363  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3600  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.25 
 
 		 776 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.25 
 
 		 670 aa  361  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  42.91 
 
 		 681 aa  359  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.25 
 
 		 705 aa  357  5e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3656  DNA ligase, NAD-dependent  40.76 
 
 		 787 aa  356  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 664 aa  356  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.96 
 
 		 786 aa  354  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  42.24 
 
 		 672 aa  353  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  40.64 
 
 		 718 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1515  NAD-dependent DNA ligase  32.48 
 
 		 668 aa  353  1e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.872196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  41.1 
 
 		 689 aa  351  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1801  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.54 
 
 		 785 aa  351  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0162634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30290  NAD-dependent DNA ligase LigA  41 
 
 		 784 aa  350  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301541  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2128  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.52 
 
 		 837 aa  348  3e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.825717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  42.21 
 
 		 675 aa  347  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  41.76 
 
 		 685 aa  347  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  40.9 
 
 		 690 aa  347  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0011  DNA ligase, NAD-dependent  33.96 
 
 		 794 aa  346  8.999999999999999e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.996124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2583  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.21 
 
 		 821 aa  346  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  42.61 
 
 		 711 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 685 aa  345  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  40.23 
 
 		 672 aa  344  4e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2047  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.25 
 
 		 831 aa  344  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  40.04 
 
 		 669 aa  343  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  43.67 
 
 		 673 aa  343  9e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  40.78 
 
 		 691 aa  343  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  42.43 
 
 		 691 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  40.78 
 
 		 690 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.6 
 
 		 694 aa  342  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  40.59 
 
 		 685 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  42.08 
 
 		 671 aa  342  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  43.57 
 
 		 725 aa  340  5e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  40.59 
 
 		 685 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  37.02 
 
 		 677 aa  340  9e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 691 aa  340  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  42.66 
 
 		 691 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  39.14 
 
 		 674 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  42.46 
 
 		 691 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  40.39 
 
 		 685 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>