More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0011 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0011  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 794 aa  1626    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.996124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3804  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.21 
 
 		 794 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  39.58 
 
 		 711 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3600  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.86 
 
 		 776 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.16 
 
 		 776 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.49 
 
 		 786 aa  475  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30290  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.35 
 
 		 784 aa  475  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.29 
 
 		 776 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2844  DNA ligase, NAD-dependent  38.52 
 
 		 707 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.764742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44660  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.97 
 
 		 794 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139158  normal  0.0637496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  38.98 
 
 		 681 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.7 
 
 		 671 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.01 
 
 		 776 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  40.41 
 
 		 672 aa  468  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  37.78 
 
 		 708 aa  464  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  38.58 
 
 		 677 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  38.79 
 
 		 708 aa  466  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.55 
 
 		 670 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  38.47 
 
 		 699 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  44.46 
 
 		 670 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  42.93 
 
 		 670 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  37.45 
 
 		 670 aa  454  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  45.21 
 
 		 673 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2583  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.9 
 
 		 821 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  37.65 
 
 		 672 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  38.5 
 
 		 700 aa  452  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  36.87 
 
 		 680 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1425  DNA ligase, NAD-dependent  37.93 
 
 		 712 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1801  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.45 
 
 		 785 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0162634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  44.44 
 
 		 673 aa  452  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  39 
 
 		 668 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.89 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.89 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.23 
 
 		 669 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.47 
 
 		 787 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.71 
 
 		 671 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.89 
 
 		 671 aa  449  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.63 
 
 		 683 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  43.89 
 
 		 673 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.71 
 
 		 671 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  42.27 
 
 		 677 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  42.29 
 
 		 680 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40.23 
 
 		 711 aa  445  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  42.75 
 
 		 668 aa  445  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  37.3 
 
 		 715 aa  446  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  42.27 
 
 		 680 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  44 
 
 		 697 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  40.09 
 
 		 675 aa  446  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.49 
 
 		 671 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.49 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3656  DNA ligase, NAD-dependent  36.45 
 
 		 787 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  44.49 
 
 		 671 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  40.98 
 
 		 663 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  43.19 
 
 		 675 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.96 
 
 		 680 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  43.24 
 
 		 726 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.49 
 
 		 671 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.49 
 
 		 671 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0004  DNA ligase, NAD-dependent  43.06 
 
 		 675 aa  441  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.3 
 
 		 671 aa  438  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.47 
 
 		 676 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  42.78 
 
 		 718 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3294  DNA ligase, NAD-dependent  36.73 
 
 		 795 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.12 
 
 		 671 aa  439  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  40.03 
 
 		 682 aa  438  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.42 
 
 		 669 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  43.12 
 
 		 670 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.34 
 
 		 673 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  42.08 
 
 		 661 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.8 
 
 		 671 aa  435  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  43.98 
 
 		 672 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  42.81 
 
 		 673 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  36.09 
 
 		 689 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.42 
 
 		 669 aa  432  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  37.47 
 
 		 725 aa  430  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.28 
 
 		 670 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.43 
 
 		 670 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  42.17 
 
 		 721 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.48 
 
 		 670 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.48 
 
 		 670 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  37.48 
 
 		 695 aa  430  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.11 
 
 		 669 aa  426  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  39.94 
 
 		 669 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  42.8 
 
 		 684 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  40.49 
 
 		 662 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  36.41 
 
 		 707 aa  428  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  42.01 
 
 		 678 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  41.71 
 
 		 674 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  41.6 
 
 		 690 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  41.47 
 
 		 662 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.05 
 
 		 673 aa  429  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3071  DNA ligase, NAD-dependent  35.86 
 
 		 704 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  37.52 
 
 		 688 aa  425  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.89 
 
 		 669 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  36.66 
 
 		 691 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  41.87 
 
 		 691 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.02 
 
 		 669 aa  426  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.58 
 
 		 694 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  36.48 
 
 		 676 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>