More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3563 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  58.39 
 
 		 688 aa  793    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  51.64 
 
 		 798 aa  673    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  67.69 
 
 		 726 aa  954    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  60.76 
 
 		 696 aa  822    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  58.05 
 
 		 691 aa  776    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  71.51 
 
 		 732 aa  1004    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  70.78 
 
 		 731 aa  999    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  60.79 
 
 		 703 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  59.95 
 
 		 723 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.82 
 
 		 701 aa  849    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  58.79 
 
 		 816 aa  782    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  57.87 
 
 		 770 aa  805    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  59.89 
 
 		 706 aa  785    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  58.28 
 
 		 736 aa  781    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  62.45 
 
 		 716 aa  850    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  63.28 
 
 		 711 aa  863    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  60.25 
 
 		 749 aa  867    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  70.11 
 
 		 775 aa  985    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  52.78 
 
 		 797 aa  695    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.82 
 
 		 701 aa  849    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 722 aa  1458    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  62.5 
 
 		 691 aa  857    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  60.39 
 
 		 871 aa  701    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  51.5 
 
 		 824 aa  710    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  57.14 
 
 		 770 aa  759    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.22 
 
 		 731 aa  840    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  51.24 
 
 		 830 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  62.73 
 
 		 710 aa  861    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.1 
 
 		 712 aa  831    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  57.58 
 
 		 790 aa  798    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.57 
 
 		 782 aa  799    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  63.81 
 
 		 695 aa  878    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  58.02 
 
 		 752 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.82 
 
 		 701 aa  849    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  62.04 
 
 		 707 aa  845    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  48.07 
 
 		 871 aa  676    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  48.16 
 
 		 673 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  46.91 
 
 		 681 aa  581  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  46.31 
 
 		 672 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  47.71 
 
 		 708 aa  573  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  45.8 
 
 		 675 aa  571  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  46.72 
 
 		 683 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  45.27 
 
 		 670 aa  566  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  44.75 
 
 		 670 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  45.9 
 
 		 705 aa  562  1.0000000000000001e-159  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  45.82 
 
 		 711 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  46.93 
 
 		 671 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 726 aa  560  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  45.48 
 
 		 691 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  44.21 
 
 		 677 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  45.96 
 
 		 675 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  45.38 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  45.38 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.99 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  44.99 
 
 		 688 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  45.44 
 
 		 708 aa  555  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  45.75 
 
 		 718 aa  552  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  45.38 
 
 		 691 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  45.38 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.55 
 
 		 683 aa  552  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  45.38 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  45.58 
 
 		 672 aa  549  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  45.38 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  44.37 
 
 		 712 aa  549  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  45.34 
 
 		 688 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  45.42 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  45.38 
 
 		 691 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  45.42 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  45.28 
 
 		 691 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  45.42 
 
 		 746 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  45.42 
 
 		 691 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.84 
 
 		 670 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  44.24 
 
 		 671 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  45.42 
 
 		 691 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 673 aa  545  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  45.49 
 
 		 725 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  45.7 
 
 		 691 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.69 
 
 		 670 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  45.16 
 
 		 685 aa  538  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  42.47 
 
 		 663 aa  534  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  43.41 
 
 		 659 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  45.14 
 
 		 672 aa  534  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  44.29 
 
 		 666 aa  535  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  41.54 
 
 		 673 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  41.39 
 
 		 670 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  42.94 
 
 		 674 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  44.36 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.27 
 
 		 681 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.21 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.36 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.22 
 
 		 671 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  44.36 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  43.55 
 
 		 661 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.22 
 
 		 671 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.64 
 
 		 670 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  44.15 
 
 		 683 aa  522  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.94 
 
 		 681 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 671 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>