More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1375 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  57.71 
 
 		 726 aa  752    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  57.22 
 
 		 731 aa  794    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  58 
 
 		 816 aa  786    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  52.45 
 
 		 871 aa  756    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  56.22 
 
 		 797 aa  793    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  51.3 
 
 		 830 aa  731    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  67.99 
 
 		 871 aa  848    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  56.33 
 
 		 691 aa  785    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.72 
 
 		 731 aa  775    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  59.06 
 
 		 770 aa  835    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  55.15 
 
 		 703 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  58.2 
 
 		 710 aa  798    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.68 
 
 		 701 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  55.31 
 
 		 716 aa  739    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  53.56 
 
 		 749 aa  735    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.03 
 
 		 691 aa  837    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  60.56 
 
 		 798 aa  842    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  53.29 
 
 		 706 aa  699    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  60.32 
 
 		 736 aa  789    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  56.86 
 
 		 723 aa  787    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.68 
 
 		 701 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  58.16 
 
 		 711 aa  790    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  60.47 
 
 		 824 aa  864    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  56.71 
 
 		 775 aa  776    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  60.51 
 
 		 770 aa  871    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  59.55 
 
 		 722 aa  831    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  61.69 
 
 		 696 aa  858    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.26 
 
 		 712 aa  817    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  60.97 
 
 		 790 aa  866    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  58.18 
 
 		 688 aa  813    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  56.38 
 
 		 695 aa  785    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  58.84 
 
 		 752 aa  761    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.68 
 
 		 701 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.08 
 
 		 707 aa  825    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 782 aa  1560    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  59.74 
 
 		 732 aa  803    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  54.76 
 
 		 920 aa  631  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  58.83 
 
 		 962 aa  617  1e-175  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.4 
 
 		 705 aa  535  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  43.72 
 
 		 708 aa  525  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  43.84 
 
 		 708 aa  520  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  43.07 
 
 		 673 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  40.98 
 
 		 681 aa  505  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  40.32 
 
 		 683 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  41.25 
 
 		 726 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  41.77 
 
 		 725 aa  495  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  41.62 
 
 		 711 aa  492  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  38.98 
 
 		 675 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  41.42 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  41.95 
 
 		 685 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  41.36 
 
 		 718 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  40.97 
 
 		 691 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  40.97 
 
 		 691 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  40.97 
 
 		 691 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  41.88 
 
 		 691 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  41.48 
 
 		 691 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  40.97 
 
 		 691 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  39.6 
 
 		 659 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  40.97 
 
 		 691 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  40.97 
 
 		 691 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  41.59 
 
 		 683 aa  479  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  40.97 
 
 		 691 aa  479  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  41.01 
 
 		 675 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.1 
 
 		 681 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  41.61 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.32 
 
 		 669 aa  475  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  41.48 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  41.02 
 
 		 690 aa  475  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  41.61 
 
 		 746 aa  475  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.84 
 
 		 669 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  41.61 
 
 		 691 aa  475  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  39.46 
 
 		 670 aa  473  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.42 
 
 		 670 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.05 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  40.05 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  40.93 
 
 		 694 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  39.25 
 
 		 668 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.05 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  39.81 
 
 		 668 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.16 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  41.18 
 
 		 671 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  40.05 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  41.88 
 
 		 693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.05 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.08 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  40 
 
 		 671 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.41 
 
 		 676 aa  469  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.67 
 
 		 681 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.21 
 
 		 684 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  39.3 
 
 		 674 aa  467  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  39.68 
 
 		 706 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  40.79 
 
 		 688 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.47 
 
 		 721 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.57 
 
 		 670 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.08 
 
 		 670 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  39.14 
 
 		 661 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.92 
 
 		 671 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.08 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.38 
 
 		 671 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>