More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  58.25 
 
 		 732 aa  745    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  57.85 
 
 		 798 aa  776    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  54.2 
 
 		 723 aa  710    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.96 
 
 		 712 aa  858    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.16 
 
 		 782 aa  810    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  57.14 
 
 		 722 aa  761    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  58.07 
 
 		 703 aa  751    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.97 
 
 		 731 aa  746    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  61.47 
 
 		 696 aa  862    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.63 
 
 		 731 aa  855    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  57.28 
 
 		 716 aa  763    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  58.08 
 
 		 770 aa  797    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  56.24 
 
 		 726 aa  708    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  59.63 
 
 		 691 aa  825    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  56.52 
 
 		 775 aa  768    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  59.64 
 
 		 710 aa  818    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  59.14 
 
 		 871 aa  717    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  57.45 
 
 		 706 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  59.48 
 
 		 711 aa  818    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  62.64 
 
 		 736 aa  805    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.29 
 
 		 701 aa  856    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  53.45 
 
 		 797 aa  724    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.29 
 
 		 701 aa  856    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  59.07 
 
 		 688 aa  794    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  52.36 
 
 		 749 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  59.4 
 
 		 790 aa  803    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  60.56 
 
 		 695 aa  829    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  57.62 
 
 		 816 aa  800    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.43 
 
 		 691 aa  848    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  61.32 
 
 		 752 aa  778    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.29 
 
 		 701 aa  856    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  62.34 
 
 		 707 aa  871    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 770 aa  1545    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  47.61 
 
 		 830 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  59.3 
 
 		 824 aa  545  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  44.19 
 
 		 708 aa  535  1e-151  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  44.74 
 
 		 708 aa  529  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  42.33 
 
 		 681 aa  527  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  41.28 
 
 		 670 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  42.44 
 
 		 726 aa  526  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  40.91 
 
 		 670 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  41.49 
 
 		 672 aa  524  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 705 aa  521  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  44.23 
 
 		 725 aa  521  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  42.86 
 
 		 718 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.34 
 
 		 670 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  42.8 
 
 		 683 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  41.36 
 
 		 683 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  40.88 
 
 		 677 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  55.37 
 
 		 962 aa  508  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  42.04 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  42.28 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  49.55 
 
 		 920 aa  504  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  41.4 
 
 		 673 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  43.12 
 
 		 685 aa  503  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.67 
 
 		 670 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  41.74 
 
 		 691 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  41.88 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  41.76 
 
 		 675 aa  497  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  41.74 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.64 
 
 		 669 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  40.2 
 
 		 666 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  41.74 
 
 		 746 aa  499  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  42.24 
 
 		 691 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  40.63 
 
 		 668 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  41.74 
 
 		 691 aa  499  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  40.48 
 
 		 670 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  40.22 
 
 		 673 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  42.7 
 
 		 673 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  42.31 
 
 		 711 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.39 
 
 		 676 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  40.14 
 
 		 671 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  40.23 
 
 		 668 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  40.14 
 
 		 663 aa  489  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  52.38 
 
 		 871 aa  491  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  42.25 
 
 		 688 aa  492  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  40.31 
 
 		 670 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.57 
 
 		 669 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.71 
 
 		 669 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.71 
 
 		 669 aa  488  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.57 
 
 		 669 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  38.56 
 
 		 678 aa  489  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.71 
 
 		 669 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.43 
 
 		 669 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  41.47 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  41.81 
 
 		 712 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.71 
 
 		 669 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  40.45 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  40.06 
 
 		 690 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.45 
 
 		 671 aa  485  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.57 
 
 		 669 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.45 
 
 		 671 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.44 
 
 		 679 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  40.45 
 
 		 674 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  41.68 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  40.43 
 
 		 721 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.57 
 
 		 669 aa  485  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  40.45 
 
 		 671 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.45 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  39.89 
 
 		 694 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>