More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  59.94 
 
 		 736 aa  683    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  58.92 
 
 		 770 aa  737    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.45 
 
 		 691 aa  705    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  51.99 
 
 		 830 aa  637    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.75 
 
 		 701 aa  730    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.22 
 
 		 731 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  59.29 
 
 		 732 aa  684    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  46.41 
 
 		 871 aa  680    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  59.61 
 
 		 710 aa  706    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  56.33 
 
 		 688 aa  655    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  52.28 
 
 		 691 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  57.98 
 
 		 716 aa  669    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  53.72 
 
 		 696 aa  775    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  57.56 
 
 		 775 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  60.39 
 
 		 722 aa  702    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  58.66 
 
 		 770 aa  711    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  60 
 
 		 726 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  67.99 
 
 		 782 aa  819    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.75 
 
 		 701 aa  730    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  59.77 
 
 		 711 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  56.15 
 
 		 816 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  54.97 
 
 		 824 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  56.45 
 
 		 798 aa  758    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.99 
 
 		 731 aa  690    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.04 
 
 		 712 aa  725    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  58.26 
 
 		 790 aa  721    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  56.96 
 
 		 723 aa  673    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  58.21 
 
 		 695 aa  678    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  46.26 
 
 		 749 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 871 aa  1749    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.75 
 
 		 701 aa  730    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  61.53 
 
 		 707 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  49.24 
 
 		 962 aa  631  1e-179  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  54.71 
 
 		 797 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  54.98 
 
 		 703 aa  629  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  55.43 
 
 		 706 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  54.19 
 
 		 920 aa  609  1e-173  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  54.85 
 
 		 752 aa  588  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  44.3 
 
 		 708 aa  465  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  43.35 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  44.24 
 
 		 673 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3804  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.56 
 
 		 794 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  36.28 
 
 		 685 aa  452  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  42.14 
 
 		 683 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.85 
 
 		 786 aa  452  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  42.14 
 
 		 672 aa  449  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  39.84 
 
 		 677 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.82 
 
 		 705 aa  452  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  36.98 
 
 		 691 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  36.86 
 
 		 689 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  41.74 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  42 
 
 		 681 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44660  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.68 
 
 		 794 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139158  normal  0.0637496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  42.2 
 
 		 670 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  37.02 
 
 		 776 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  36.09 
 
 		 685 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  35.96 
 
 		 685 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  41.49 
 
 		 691 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  36.09 
 
 		 685 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  42.42 
 
 		 726 aa  445  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  36.23 
 
 		 690 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  36.35 
 
 		 690 aa  446  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.52 
 
 		 776 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3600  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.55 
 
 		 776 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  41.18 
 
 		 691 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  40.48 
 
 		 683 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  40.99 
 
 		 746 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  41.33 
 
 		 691 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 669 aa  437  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 669 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 		 669 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.1 
 
 		 669 aa  438  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 669 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  40 
 
 		 711 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.77 
 
 		 669 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.26 
 
 		 669 aa  439  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.79 
 
 		 776 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  42.77 
 
 		 718 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.1 
 
 		 669 aa  439  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  42.72 
 
 		 691 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  40.62 
 
 		 673 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  41.18 
 
 		 691 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  42.81 
 
 		 725 aa  438  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.45 
 
 		 669 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.97 
 
 		 669 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.22 
 
 		 787 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1801  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.43 
 
 		 785 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0162634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  40.53 
 
 		 688 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  41.73 
 
 		 685 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  35 
 
 		 738 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.81 
 
 		 670 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>