More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2404 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  50.12 
 
 		 696 aa  673    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  52.19 
 
 		 732 aa  701    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 830 aa  1651    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.72 
 
 		 731 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  51.35 
 
 		 722 aa  720    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  49.6 
 
 		 797 aa  680    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  50.06 
 
 		 775 aa  690    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  51.19 
 
 		 726 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  54.72 
 
 		 871 aa  816    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  49.88 
 
 		 770 aa  723    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.9 
 
 		 701 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  47.27 
 
 		 798 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  52.2 
 
 		 824 aa  757    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  48.89 
 
 		 749 aa  720    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.9 
 
 		 701 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  49.94 
 
 		 790 aa  718    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  52.09 
 
 		 871 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.9 
 
 		 701 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.79 
 
 		 782 aa  700    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  48.26 
 
 		 688 aa  634  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  47.18 
 
 		 770 aa  633  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  45.99 
 
 		 723 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  42.14 
 
 		 962 aa  612  1e-173  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.34 
 
 		 707 aa  604  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.47 
 
 		 712 aa  596  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  48.69 
 
 		 752 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  46.32 
 
 		 695 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  44.2 
 
 		 691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.81 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  44.65 
 
 		 716 aa  558  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.07 
 
 		 731 aa  548  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  54.28 
 
 		 710 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  54.26 
 
 		 711 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  52.8 
 
 		 816 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  53.92 
 
 		 736 aa  489  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  47.77 
 
 		 920 aa  482  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  38.7 
 
 		 672 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  52.91 
 
 		 703 aa  462  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  52.63 
 
 		 706 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.7 
 
 		 670 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.17 
 
 		 669 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.17 
 
 		 669 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.17 
 
 		 669 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.17 
 
 		 669 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.92 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  38.14 
 
 		 708 aa  439  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  38 
 
 		 685 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.79 
 
 		 669 aa  438  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.79 
 
 		 669 aa  438  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  35.81 
 
 		 663 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2746  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.32 
 
 		 786 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0339353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  37.68 
 
 		 711 aa  412  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  37.81 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.67 
 
 		 669 aa  412  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  38.27 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.67 
 
 		 669 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.79 
 
 		 669 aa  412  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  35.32 
 
 		 661 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0729  DNA ligase, NAD-dependent  38.36 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  36.33 
 
 		 666 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  37.45 
 
 		 691 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  37.07 
 
 		 697 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  36.34 
 
 		 666 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  32.46 
 
 		 662 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  35.74 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  34.72 
 
 		 674 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.47 
 
 		 670 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.8 
 
 		 671 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  35.43 
 
 		 670 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1812  DNA ligase (NAD+)  37.8 
 
 		 677 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3804  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.42 
 
 		 794 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1801  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.42 
 
 		 785 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0162634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  36.51 
 
 		 698 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  35.48 
 
 		 659 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.33 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  35.33 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.33 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.33 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.33 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  35.33 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.33 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3600  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.86 
 
 		 776 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.21 
 
 		 671 aa  389  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1594  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.48 
 
 		 776 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0867553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  38.47 
 
 		 673 aa  389  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30290  NAD-dependent DNA ligase LigA  36.7 
 
 		 784 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4274  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.29 
 
 		 776 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3838  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.22 
 
 		 776 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.771384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.64 
 
 		 676 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  34.08 
 
 		 662 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44660  NAD-dependent DNA ligase LigA  35.74 
 
 		 794 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139158  normal  0.0637496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  35.07 
 
 		 670 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0850  NAD-dependent DNA ligase LigA  32.24 
 
 		 652 aa  382  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  34.19 
 
 		 673 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1819  NAD-dependent DNA ligase LigA  34.99 
 
 		 787 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  34.64 
 
 		 680 aa  382  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  35.49 
 
 		 671 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  43 
 
 		 672 aa  382  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  34.97 
 
 		 670 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.75 
 
 		 669 aa  379  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>