More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0729 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0735  DNA ligase, NAD-dependent  81.94 
 
 		 699 aa  1116    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  50.87 
 
 		 672 aa  641    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  98.84 
 
 		 687 aa  1350    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  95.85 
 
 		 687 aa  1299    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0729  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 687 aa  1370    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  53.13 
 
 		 673 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  48.98 
 
 		 672 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  49.78 
 
 		 671 aa  621  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  49.85 
 
 		 683 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  48.55 
 
 		 670 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  49.93 
 
 		 707 aa  598  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  50.58 
 
 		 673 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.34 
 
 		 681 aa  597  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.4 
 
 		 673 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.59 
 
 		 670 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.59 
 
 		 670 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.77 
 
 		 681 aa  594  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.59 
 
 		 670 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  49.13 
 
 		 690 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  48.3 
 
 		 706 aa  595  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  51.32 
 
 		 693 aa  590  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  49.93 
 
 		 691 aa  589  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  50.14 
 
 		 683 aa  586  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  49.85 
 
 		 675 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  48.75 
 
 		 711 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  47.08 
 
 		 677 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  49.35 
 
 		 694 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  47.17 
 
 		 675 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2841  DNA ligase, NAD-dependent  48.44 
 
 		 732 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  46.92 
 
 		 681 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 683 aa  582  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 691 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.56 
 
 		 670 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 691 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  48.42 
 
 		 711 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  46 
 
 		 668 aa  579  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  46.29 
 
 		 668 aa  582  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 691 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 691 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 691 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  48.84 
 
 		 688 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  48.21 
 
 		 671 aa  581  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  45.04 
 
 		 663 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 691 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  49.49 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  45.76 
 
 		 690 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  49.13 
 
 		 688 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 		 678 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  49.64 
 
 		 691 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  48.77 
 
 		 691 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  44.9 
 
 		 673 aa  573  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  45.77 
 
 		 671 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  48.84 
 
 		 691 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  46.82 
 
 		 707 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  47.76 
 
 		 721 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  47.91 
 
 		 671 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  48.99 
 
 		 691 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  48.99 
 
 		 691 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  48.55 
 
 		 691 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  49.57 
 
 		 686 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  44.61 
 
 		 670 aa  570  1e-161  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3592  DNA ligase, NAD-dependent  48.99 
 
 		 703 aa  569  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0307521  normal  0.0769861 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  48.41 
 
 		 746 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  48.41 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  47.28 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  47.28 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  568  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.02 
 
 		 670 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.43 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  45.95 
 
 		 674 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  45.4 
 
 		 670 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2083  DNA ligase, NAD-dependent  47.16 
 
 		 731 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0521924  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  45.89 
 
 		 673 aa  562  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  47.97 
 
 		 666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.56 
 
 		 670 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.59 
 
 		 673 aa  562  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.95 
 
 		 662 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  48.36 
 
 		 697 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.01 
 
 		 669 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  46.67 
 
 		 694 aa  564  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4463  DNA ligase, NAD-dependent  48 
 
 		 693 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0518609  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.44 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0835  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.21 
 
 		 684 aa  561  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  45.51 
 
 		 673 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.5 
 
 		 682 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1672  DNA ligase, NAD-dependent  47.44 
 
 		 740 aa  561  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.672303  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  45.75 
 
 		 669 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.28 
 
 		 671 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.2 
 
 		 676 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  46.93 
 
 		 671 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  46.62 
 
 		 682 aa  558  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  45.29 
 
 		 670 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>