More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1298 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  53.03 
 
 		 816 aa  733    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  56 
 
 		 710 aa  771    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  50.18 
 
 		 871 aa  734    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  59.84 
 
 		 871 aa  719    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  55.76 
 
 		 711 aa  759    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.43 
 
 		 701 aa  823    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  53.93 
 
 		 749 aa  766    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.96 
 
 		 782 aa  850    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.14 
 
 		 731 aa  744    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  54.24 
 
 		 798 aa  738    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  55.36 
 
 		 732 aa  743    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  55.45 
 
 		 691 aa  766    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  56.01 
 
 		 716 aa  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  58.6 
 
 		 775 aa  792    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  55.87 
 
 		 688 aa  760    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  55.45 
 
 		 703 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  57.96 
 
 		 770 aa  798    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.74 
 
 		 691 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  53.31 
 
 		 706 aa  709    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  52.14 
 
 		 824 aa  709    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  57.48 
 
 		 722 aa  800    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.15 
 
 		 731 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  56.68 
 
 		 736 aa  735    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.43 
 
 		 701 aa  823    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  82.86 
 
 		 770 aa  1299    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  57.18 
 
 		 723 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.84 
 
 		 712 aa  799    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  55.62 
 
 		 726 aa  734    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 790 aa  1604    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  65.07 
 
 		 797 aa  946    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  58.82 
 
 		 695 aa  788    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  58.31 
 
 		 696 aa  812    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  55.67 
 
 		 752 aa  753    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  49.94 
 
 		 830 aa  714    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.43 
 
 		 701 aa  823    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.85 
 
 		 707 aa  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.83 
 
 		 705 aa  546  1e-154  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  44.4 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  44.28 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  42.6 
 
 		 681 aa  532  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  42.38 
 
 		 725 aa  523  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  43.14 
 
 		 673 aa  525  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  42.45 
 
 		 670 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  41.24 
 
 		 672 aa  515  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  42.48 
 
 		 683 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  41.31 
 
 		 726 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  41.78 
 
 		 718 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  42.58 
 
 		 746 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  42.54 
 
 		 691 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  41.83 
 
 		 691 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  42.54 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  42.25 
 
 		 691 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  41.15 
 
 		 683 aa  505  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  41.92 
 
 		 691 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  41.89 
 
 		 688 aa  502  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  41.69 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  42.17 
 
 		 688 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  41.79 
 
 		 691 aa  502  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.38 
 
 		 670 aa  502  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  42.02 
 
 		 711 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  41.72 
 
 		 664 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  41.55 
 
 		 691 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  41.5 
 
 		 685 aa  495  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.26 
 
 		 681 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  41 
 
 		 668 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  39.66 
 
 		 675 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  42.42 
 
 		 675 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  40.86 
 
 		 668 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.59 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  41.14 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  50.47 
 
 		 920 aa  487  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  41 
 
 		 671 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  43.27 
 
 		 693 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.88 
 
 		 671 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.7 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  40.11 
 
 		 690 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.85 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.59 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  40.59 
 
 		 671 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  40.34 
 
 		 674 aa  489  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.14 
 
 		 671 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0696  DNA ligase, NAD-dependent  42.23 
 
 		 684 aa  489  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  39.72 
 
 		 670 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  49.63 
 
 		 962 aa  489  1e-136  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  40.59 
 
 		 678 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.88 
 
 		 671 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  41.13 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  41.13 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  37.99 
 
 		 662 aa  486  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  41.13 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  41.13 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.74 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  40.86 
 
 		 663 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.88 
 
 		 671 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  41.13 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  39.8 
 
 		 677 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  41.13 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.88 
 
 		 671 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.45 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  41.13 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>