More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6038 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  52.02 
 
 		 797 aa  682    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  57.5 
 
 		 723 aa  805    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  70.96 
 
 		 731 aa  985    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  54.14 
 
 		 770 aa  739    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  58 
 
 		 782 aa  767    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  58.81 
 
 		 722 aa  805    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  57 
 
 		 731 aa  761    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  67.01 
 
 		 688 aa  906    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  63.58 
 
 		 716 aa  850    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  68.36 
 
 		 691 aa  916    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  66.03 
 
 		 696 aa  881    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  58.6 
 
 		 703 aa  745    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  68.34 
 
 		 701 aa  913    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  55.89 
 
 		 749 aa  795    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  66.81 
 
 		 710 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  57.21 
 
 		 706 aa  725    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  56.38 
 
 		 775 aa  788    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  66.67 
 
 		 711 aa  891    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  65.31 
 
 		 736 aa  856    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  66.62 
 
 		 712 aa  908    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  57 
 
 		 726 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  68.34 
 
 		 701 aa  913    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  65.83 
 
 		 691 aa  910    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  51.99 
 
 		 798 aa  689    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  57.62 
 
 		 770 aa  808    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  53.03 
 
 		 790 aa  742    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  62.14 
 
 		 695 aa  842    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  62.03 
 
 		 752 aa  801    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 816 aa  1612    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  68.34 
 
 		 701 aa  913    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  66.81 
 
 		 707 aa  924    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  51.81 
 
 		 871 aa  744    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  57.48 
 
 		 732 aa  764    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  62.53 
 
 		 824 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  47.2 
 
 		 708 aa  566  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  44.28 
 
 		 670 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  46.11 
 
 		 708 aa  552  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  47.66 
 
 		 725 aa  540  9.999999999999999e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  44.59 
 
 		 681 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  44.15 
 
 		 718 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  44.2 
 
 		 672 aa  535  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  45.15 
 
 		 705 aa  533  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  43.38 
 
 		 726 aa  531  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.83 
 
 		 683 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  45.66 
 
 		 673 aa  525  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  44.23 
 
 		 672 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  44.79 
 
 		 671 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  41.96 
 
 		 670 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  43.87 
 
 		 711 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  45.58 
 
 		 685 aa  511  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.33 
 
 		 670 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  44.2 
 
 		 691 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  43.5 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  53.85 
 
 		 962 aa  504  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  44.9 
 
 		 691 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  43.37 
 
 		 673 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  49.63 
 
 		 920 aa  500  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.89 
 
 		 670 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 691 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 691 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  44.1 
 
 		 683 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  45.01 
 
 		 697 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  43.76 
 
 		 691 aa  499  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.75 
 
 		 681 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  43.61 
 
 		 691 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.79 
 
 		 677 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  42.35 
 
 		 684 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  39.91 
 
 		 663 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  40.77 
 
 		 688 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  43.47 
 
 		 746 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  44.03 
 
 		 691 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  43.47 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  40.77 
 
 		 688 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.6 
 
 		 681 aa  492  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.03 
 
 		 668 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  43.32 
 
 		 691 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  42.6 
 
 		 666 aa  490  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  52.8 
 
 		 830 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.67 
 
 		 673 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 668 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 670 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.74 
 
 		 672 aa  489  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  43.03 
 
 		 678 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  44.02 
 
 		 675 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  40.77 
 
 		 675 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  42.27 
 
 		 671 aa  489  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  43.6 
 
 		 694 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  42.94 
 
 		 666 aa  487  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  42.79 
 
 		 673 aa  487  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.71 
 
 		 670 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  44.59 
 
 		 673 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  42.81 
 
 		 688 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.71 
 
 		 670 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.71 
 
 		 670 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  42.26 
 
 		 706 aa  483  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>