More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1313 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  57.61 
 
 		 691 aa  814    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  54.25 
 
 		 770 aa  711    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  59.78 
 
 		 732 aa  816    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  57.89 
 
 		 816 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 797 aa  674    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  56.96 
 
 		 871 aa  681    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  59.07 
 
 		 731 aa  810    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  53.86 
 
 		 691 aa  756    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  56.24 
 
 		 736 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  55.95 
 
 		 749 aa  790    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 723 aa  1473    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  54.61 
 
 		 770 aa  772    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  56.76 
 
 		 716 aa  766    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  53.6 
 
 		 706 aa  721    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  57.59 
 
 		 712 aa  794    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18930  DNA ligase, NAD-dependent  46.01 
 
 		 871 aa  640    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333136  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  57.54 
 
 		 775 aa  790    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  60.68 
 
 		 711 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  58 
 
 		 696 aa  791    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  51.08 
 
 		 798 aa  686    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  55.77 
 
 		 703 aa  749    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.86 
 
 		 782 aa  781    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  55.54 
 
 		 726 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.29 
 
 		 701 aa  806    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  59.95 
 
 		 722 aa  852    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  55.27 
 
 		 688 aa  768    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.29 
 
 		 701 aa  806    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  49.07 
 
 		 824 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  60.76 
 
 		 710 aa  837    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  57.24 
 
 		 790 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  58.31 
 
 		 695 aa  799    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.1 
 
 		 731 aa  808    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  59.24 
 
 		 752 aa  779    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.29 
 
 		 701 aa  806    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.72 
 
 		 707 aa  801    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  46.15 
 
 		 830 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  43.02 
 
 		 708 aa  518  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  41.85 
 
 		 726 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  44.49 
 
 		 673 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  41.64 
 
 		 672 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  41.45 
 
 		 681 aa  501  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  41.42 
 
 		 718 aa  501  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  42.9 
 
 		 670 aa  502  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  42.48 
 
 		 683 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  42.52 
 
 		 691 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  42.45 
 
 		 705 aa  490  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  41.33 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  53.9 
 
 		 962 aa  490  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  42.41 
 
 		 712 aa  489  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  43.14 
 
 		 708 aa  491  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  41.18 
 
 		 675 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  40.82 
 
 		 677 aa  489  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  41.57 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  41.44 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  41.76 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  43.06 
 
 		 725 aa  485  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  41.62 
 
 		 746 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  52.47 
 
 		 920 aa  485  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  41.62 
 
 		 691 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  41.31 
 
 		 670 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  40.46 
 
 		 674 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  41.93 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  40.22 
 
 		 721 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  40.22 
 
 		 683 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  41.48 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 691 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 691 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  40.63 
 
 		 672 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.72 
 
 		 671 aa  479  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  40.94 
 
 		 691 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  40.73 
 
 		 688 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  41.01 
 
 		 688 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  38.9 
 
 		 670 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.91 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  40.83 
 
 		 671 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  41.2 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.91 
 
 		 671 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  41.07 
 
 		 685 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.35 
 
 		 671 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 671 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  39.35 
 
 		 671 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.17 
 
 		 670 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.94 
 
 		 671 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.17 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.17 
 
 		 670 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.91 
 
 		 671 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  41.28 
 
 		 673 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  40.69 
 
 		 661 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  40.31 
 
 		 694 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.35 
 
 		 671 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  39.35 
 
 		 671 aa  465  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.35 
 
 		 671 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  39.49 
 
 		 685 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.35 
 
 		 671 aa  465  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  40.08 
 
 		 690 aa  464  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>