More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2112 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08690  NAD-dependent DNA ligase LigA  69.08 
 
 		 731 aa  971    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10480  DNA ligase, NAD-dependent  61.53 
 
 		 871 aa  737    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1716  DNA ligase, NAD-dependent  52.5 
 
 		 798 aa  721    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1315  DNA ligase, NAD-dependent  68.73 
 
 		 696 aa  939    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2365  DNA ligase NAD-dependent  54.26 
 
 		 749 aa  778    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1109  DNA ligase, NAD-dependent  65.24 
 
 		 710 aa  875    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.822067  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4248  NAD-dependent DNA ligase LigA  89.9 
 
 		 712 aa  1285    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0769437  normal  0.764514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3563  DNA ligase, NAD-dependent  62.04 
 
 		 722 aa  845    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.413726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0603  NAD-dependent DNA ligase LigA  58.24 
 
 		 731 aa  775    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1861  NAD-dependent DNA ligase LigA  84.7 
 
 		 701 aa  1214    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0141215  normal  0.135266 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2839  NAD-dependent DNA ligase  60.56 
 
 		 732 aa  799    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13029  NAD-dependent DNA ligase LigA  81.87 
 
 		 691 aa  1136    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00166162  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2900  DNA ligase, NAD-dependent  73.6 
 
 		 688 aa  1022    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  61.22 
 
 		 706 aa  768    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0160  DNA ligase, NAD-dependent  59.19 
 
 		 775 aa  791    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  60.67 
 
 		 703 aa  770    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1217  DNA ligase, NAD-dependent  65.1 
 
 		 711 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.554816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1342  DNA ligase, NAD-dependent  58.38 
 
 		 770 aa  801    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000259752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6038  DNA ligase, NAD-dependent  66.81 
 
 		 816 aa  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1450  DNA ligase, NAD-dependent  70.33 
 
 		 736 aa  892    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.824351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1881  NAD-dependent DNA ligase LigA  84.7 
 
 		 701 aa  1214    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3250  DNA ligase, NAD-dependent  74.08 
 
 		 691 aa  1029    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1313  DNA ligase, NAD-dependent  56.16 
 
 		 723 aa  797    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09780  DNA ligase, NAD-dependent  62.34 
 
 		 770 aa  868    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0919066  normal  0.0297571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4086  DNA ligase, NAD-dependent  65.7 
 
 		 716 aa  875    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05940  DNA ligase, NAD-dependent  54.01 
 
 		 797 aa  735    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8077  DNA ligase (NAD(+))  59.38 
 
 		 726 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1298  DNA ligase, NAD-dependent  58.85 
 
 		 790 aa  814    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1375  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.08 
 
 		 782 aa  790    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  65.41 
 
 		 695 aa  887    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3440  DNA ligase, NAD-dependent  63.19 
 
 		 752 aa  807    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1927  NAD-dependent DNA ligase LigA  84.7 
 
 		 701 aa  1214    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2112  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 707 aa  1424    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2404  DNA ligase, NAD-dependent  46.26 
 
 		 830 aa  598  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68364  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  47.21 
 
 		 681 aa  568  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  45.2 
 
 		 672 aa  558  1e-157  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  45.97 
 
 		 726 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.74 
 
 		 683 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  45.84 
 
 		 708 aa  548  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  46.38 
 
 		 671 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  45.28 
 
 		 671 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  45.13 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  46.13 
 
 		 685 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  45.55 
 
 		 718 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  45.05 
 
 		 666 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  42.4 
 
 		 670 aa  535  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1113  DNA ligase, NAD-dependent  59.07 
 
 		 824 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.445246  hitchhiker  0.00383916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  44.25 
 
 		 677 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  44.02 
 
 		 670 aa  533  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  46.22 
 
 		 673 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.81 
 
 		 668 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.63 
 
 		 670 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  45.32 
 
 		 712 aa  530  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  45.28 
 
 		 672 aa  531  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.86 
 
 		 668 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0066  NAD-dependent DNA ligase  56.72 
 
 		 920 aa  526  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  46.62 
 
 		 675 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.71 
 
 		 705 aa  528  1e-148  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  43.64 
 
 		 663 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  44.67 
 
 		 691 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0781  DNA ligase (NAD(+))  56.71 
 
 		 962 aa  524  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.72 
 
 		 683 aa  522  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  45.36 
 
 		 664 aa  520  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  46.05 
 
 		 725 aa  520  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  44.76 
 
 		 670 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  44.72 
 
 		 690 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  46.98 
 
 		 693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  44.36 
 
 		 711 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  42.98 
 
 		 675 aa  513  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  43.47 
 
 		 674 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  44.37 
 
 		 746 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  46.06 
 
 		 673 aa  514  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  44.56 
 
 		 691 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  44.37 
 
 		 691 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2950  DNA ligase, NAD-dependent  44.59 
 
 		 694 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.191754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 672 aa  512  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.94 
 
 		 670 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  44.37 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  44.51 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  44.62 
 
 		 688 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  44 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  44.48 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  44.17 
 
 		 678 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  43.77 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  43.64 
 
 		 707 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  43.76 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1689  DNA ligase, NAD-dependent  42.56 
 
 		 668 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000649064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 		 681 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  44.26 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  43.77 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.73 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 671 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  43.62 
 
 		 691 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.62 
 
 		 671 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  44.36 
 
 		 706 aa  502  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  41.84 
 
 		 662 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  42.45 
 
 		 673 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  43.22 
 
 		 666 aa  500  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>