More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0696 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1670  DNA ligase NAD-dependent  51.66 
 
 		 666 aa  647    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.229082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0696  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 684 aa  1384    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2086  DNA ligase, NAD-dependent  52.28 
 
 		 670 aa  630  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  47.55 
 
 		 677 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  47.33 
 
 		 711 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  47.12 
 
 		 672 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  46.03 
 
 		 678 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  46.27 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  47.28 
 
 		 673 aa  547  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 666 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  45.49 
 
 		 681 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  44.02 
 
 		 663 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  46.38 
 
 		 726 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  45.92 
 
 		 670 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0624  NAD-dependent DNA ligase  48.03 
 
 		 686 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.182096  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  43.88 
 
 		 708 aa  539  9.999999999999999e-153  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  46.55 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.13 
 
 		 683 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.54 
 
 		 670 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.15 
 
 		 671 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  43.57 
 
 		 670 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  45.71 
 
 		 693 aa  537  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  45.24 
 
 		 721 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.23 
 
 		 671 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  45.74 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.3 
 
 		 671 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  44.32 
 
 		 715 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  46.83 
 
 		 693 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  44.77 
 
 		 714 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  43.61 
 
 		 708 aa  534  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.08 
 
 		 671 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  46 
 
 		 671 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  44.9 
 
 		 683 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  44.99 
 
 		 695 aa  532  1e-150  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  45.55 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  46.28 
 
 		 718 aa  530  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  43.48 
 
 		 668 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  45.59 
 
 		 672 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.66 
 
 		 676 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  44.69 
 
 		 691 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  44.13 
 
 		 674 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  45.55 
 
 		 671 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  43.93 
 
 		 705 aa  530  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.25 
 
 		 673 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.55 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.67 
 
 		 670 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.19 
 
 		 670 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  45.88 
 
 		 683 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  44.95 
 
 		 691 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.4 
 
 		 668 aa  527  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.93 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.67 
 
 		 670 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0163  DNA ligase, NAD-dependent  46.92 
 
 		 685 aa  527  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  44.11 
 
 		 673 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.93 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.67 
 
 		 670 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  43.7 
 
 		 680 aa  526  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  46.34 
 
 		 675 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.11 
 
 		 671 aa  525  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  44.8 
 
 		 691 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  44.43 
 
 		 671 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.25 
 
 		 671 aa  525  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  44.38 
 
 		 714 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  44.25 
 
 		 688 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  43.56 
 
 		 673 aa  524  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  44.8 
 
 		 746 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  44.8 
 
 		 691 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3403  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.83 
 
 		 681 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  44.66 
 
 		 691 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  43.56 
 
 		 675 aa  521  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.56 
 
 		 679 aa  519  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  45.71 
 
 		 673 aa  521  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  43.94 
 
 		 691 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  44.14 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  45.72 
 
 		 685 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  42.94 
 
 		 659 aa  522  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  44.51 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  43.97 
 
 		 697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  43.33 
 
 		 688 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3562  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.92 
 
 		 681 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  43.8 
 
 		 691 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  41.36 
 
 		 667 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  45.97 
 
 		 680 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3647  DNA ligase, NAD-dependent  44.88 
 
 		 706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  41.36 
 
 		 667 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  43.66 
 
 		 707 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1554  DNA ligase, NAD-dependent  46.15 
 
 		 664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.344764  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.04 
 
 		 673 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1082  DNA ligase, NAD-dependent  44.68 
 
 		 703 aa  515  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.12807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  41.97 
 
 		 662 aa  515  1e-144  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  43.75 
 
 		 672 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  42.4 
 
 		 673 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  43.9 
 
 		 681 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>