More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0937 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4083  DNA ligase, NAD-dependent  54.2 
 
 		 765 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316882  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1754  NAD-dependent DNA ligase LigA  64.81 
 
 		 721 aa  915    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0937  NAD-dependent DNA ligase LigA  100 
 
 		 717 aa  1477    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0205713  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1420  NAD-dependent DNA ligase LigA  65.92 
 
 		 719 aa  956    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4035  DNA ligase, NAD-dependent  57.98 
 
 		 715 aa  784    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1159  DNA ligase, NAD-dependent  56.29 
 
 		 704 aa  740    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.227634  normal  0.637978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2432  DNA ligase, NAD-dependent  58.97 
 
 		 710 aa  797    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1762  DNA ligase, NAD-dependent  57.84 
 
 		 720 aa  773    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654069  normal  0.115232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1376  NAD-dependent DNA ligase LigA  65.78 
 
 		 719 aa  955    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390799  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1062  NAD-dependent DNA ligase  57.14 
 
 		 716 aa  797    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.759691  normal  0.781607 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1509  DNA ligase  55.49 
 
 		 741 aa  755    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.655718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2622  DNA ligase  56.19 
 
 		 704 aa  729    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.477478  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2840  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.56 
 
 		 718 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229062  normal  0.0102416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2579  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.7 
 
 		 718 aa  865    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0939  DNA ligase (NAD+)  53.12 
 
 		 698 aa  687    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0706  DNA ligase, NAD-dependent  59.31 
 
 		 699 aa  848    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.948055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2008  DNA ligase, NAD-dependent  57.42 
 
 		 714 aa  764    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.843308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1738  DNA ligase, NAD-dependent  49.86 
 
 		 721 aa  676    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00107521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2504  DNA ligase, NAD-dependent  52.08 
 
 		 752 aa  708    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.234774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3294  DNA ligase, NAD-dependent  48.44 
 
 		 795 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3381  DNA ligase, NAD-dependent  56.66 
 
 		 714 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113379  hitchhiker  0.00670333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1290  DNA ligase, NAD-dependent  56.86 
 
 		 714 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67847  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1280  DNA ligase, NAD-dependent  55.12 
 
 		 704 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.334632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1398  DNA ligase, NAD-dependent  52.3 
 
 		 739 aa  704    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.695979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0549  DNA ligase, NAD-dependent  53.59 
 
 		 714 aa  669    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183807  normal  0.14967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1997  DNA ligase, NAD-dependent  58.99 
 
 		 703 aa  778    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2876  NAD-dependent DNA ligase LigA  60.61 
 
 		 719 aa  857    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0956415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2066  DNA ligase, NAD-dependent  54.31 
 
 		 701 aa  687    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3499  DNA ligase, NAD-dependent  57.08 
 
 		 700 aa  801    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3160  DNA ligase, NAD-dependent  49.79 
 
 		 708 aa  645    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.780726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2070  NAD-dependent DNA ligase LigA  62.03 
 
 		 717 aa  874    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4727  DNA ligase, NAD-dependent  52.32 
 
 		 708 aa  661    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6162  DNA ligase (polydeoxyribonucleotide synthase (NAD+))  56.03 
 
 		 716 aa  768    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4642  DNA ligase, NAD-dependent  51.63 
 
 		 814 aa  634  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5183  DNA ligase, NAD-dependent  51.48 
 
 		 814 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5105  DNA ligase, NAD-dependent  50.7 
 
 		 814 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.599059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0491  DNA ligase, NAD-dependent  50.08 
 
 		 829 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3097  DNA ligase, NAD-dependent  45.65 
 
 		 792 aa  613  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3071  DNA ligase, NAD-dependent  45.61 
 
 		 704 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.678716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0011  DNA ligase, NAD-dependent  50.56 
 
 		 810 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1689  DNA ligase, NAD-dependent  49.37 
 
 		 827 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.914748 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  46.85 
 
 		 671 aa  578  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0702  NAD-dependent DNA ligase  43.73 
 
 		 677 aa  579  1e-164  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  42.62 
 
 		 672 aa  580  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0301  DNA ligase, NAD-dependent  43.71 
 
 		 676 aa  580  1e-164  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.10932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0757  DNA ligase, NAD-dependent  49.7 
 
 		 682 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.320079  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  46.56 
 
 		 671 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  45.09 
 
 		 711 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  45.11 
 
 		 674 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1776  DNA ligase, NAD-dependent  43.86 
 
 		 677 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.19429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  46.98 
 
 		 673 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  45.59 
 
 		 673 aa  568  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.05 
 
 		 671 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 671 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  44.11 
 
 		 685 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2679  DNA ligase, NAD-dependent  43.99 
 
 		 685 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018832  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.6 
 
 		 669 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2758  DNA ligase, NAD-dependent  43.99 
 
 		 685 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00554758  hitchhiker  0.000696981 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  43.91 
 
 		 671 aa  568  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 671 aa  568  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.91 
 
 		 671 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01312  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.08 
 
 		 670 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3466  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 689 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  45.39 
 
 		 683 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  44.73 
 
 		 690 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.77 
 
 		 671 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1705  DNA ligase, NAD-dependent  43.56 
 
 		 685 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000114947  decreased coverage  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  44.79 
 
 		 690 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  46.43 
 
 		 675 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.71 
 
 		 671 aa  558  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.97 
 
 		 670 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.63 
 
 		 671 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  45.29 
 
 		 683 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.97 
 
 		 670 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.97 
 
 		 670 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  44.46 
 
 		 688 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.63 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0776  DNA ligase, NAD-dependent  45.61 
 
 		 662 aa  558  1e-157  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.48 
 
 		 671 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.48 
 
 		 671 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0801  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.15 
 
 		 682 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  44.46 
 
 		 688 aa  555  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2514  DNA ligase, NAD-dependent  45.11 
 
 		 670 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00116351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  45.97 
 
 		 691 aa  553  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 690 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2377  DNA ligase, NAD-dependent  44.02 
 
 		 669 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000760862  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  43.71 
 
 		 670 aa  549  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  44.11 
 
 		 691 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  44.7 
 
 		 706 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1516  DNA ligase (NAD(+))  43.2 
 
 		 681 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000678531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 690 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  43.91 
 
 		 670 aa  549  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  43.25 
 
 		 691 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1403  DNA ligase, NAD-dependent  44.57 
 
 		 693 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.655941  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  43.86 
 
 		 691 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  44.11 
 
 		 691 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  42.92 
 
 		 691 aa  548  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>