110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6953 on replicon NC_013732
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 390 aa  772    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  38.64 
 
 		 478 aa  269  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  38.38 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  34.23 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  36.52 
 
 		 460 aa  232  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  36.75 
 
 		 460 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  36.48 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  32.6 
 
 		 542 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 		 522 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  29.21 
 
 		 544 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  28.87 
 
 		 560 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  29.36 
 
 		 551 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  35.07 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  28.41 
 
 		 554 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  31.66 
 
 		 437 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  30.21 
 
 		 518 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  31.62 
 
 		 541 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  32.56 
 
 		 448 aa  179  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 474 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  29.95 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  30.42 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  29.38 
 
 		 509 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  32.56 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  32.99 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  29.09 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  28.47 
 
 		 865 aa  163  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  27.88 
 
 		 462 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7020  hypothetical protein  33.71 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361507  normal  0.742896 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  28.29 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  28.23 
 
 		 455 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  28.61 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  26.79 
 
 		 727 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1489  Polygalacturonase/Pectinase  29.95 
 
 		 544 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  27.41 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  31.55 
 
 		 521 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  28.46 
 
 		 489 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3629  glycoside hydrolase family 28  29.62 
 
 		 488 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  30.35 
 
 		 532 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3630  glycoside hydrolase family 28  30.19 
 
 		 513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 491 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  31.75 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  30.55 
 
 		 442 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 		 442 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  29.68 
 
 		 524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  27.76 
 
 		 518 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  30.56 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  29.21 
 
 		 602 aa  126  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1628  polygalacturonase precursor  26.74 
 
 		 544 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  32.26 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  28.83 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0880  polygalacturonase precursor (pectinase) signal peptide protein  30.86 
 
 		 531 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609321  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1570  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 544 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  29.9 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 479 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  29.11 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4887  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3277  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 458 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  28.57 
 
 		 602 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  25.92 
 
 		 543 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  25.92 
 
 		 548 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  27.03 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  23.68 
 
 		 659 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  23.9 
 
 		 659 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  26.51 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 606 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  26.29 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  27.76 
 
 		 604 aa  99.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  29.05 
 
 		 559 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03389  xylogalacturonan hydrolase (Eurofung)  27.4 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.176918  normal  0.718699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  28.49 
 
 		 605 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  29.35 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 		 665 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  26.62 
 
 		 454 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  34.27 
 
 		 680 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  34.27 
 
 		 671 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  23.55 
 
 		 537 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  32.58 
 
 		 665 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  32.02 
 
 		 665 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  32.02 
 
 		 664 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  25.4 
 
 		 543 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  27.36 
 
 		 649 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  24.45 
 
 		 702 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5982  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 716 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.113133 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08891  Exopolygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q873X6]  29.03 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08761  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ASG9]  24.21 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.987401 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08327  Endo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ATQ3]  26.19 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.23769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5664  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 725 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6029  glycoside hydrolase family protein  25.43 
 
 		 725 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0491802  normal  0.885513 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04372  Endo-polygalacturonase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT2]  28.03 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.217421 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  29.27 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10274  exo-polygalacturonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06410)  26.05 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  33.79 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06656  endopolygalacturonase (Eurofung)  26.07 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09045  Exo-polygalacturonasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARN5]  25.94 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787834  normal  0.693442 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02590  polygalacturonase, putative  23.93 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>