298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1424 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 604 aa  1233    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  35.85 
 
 		 573 aa  320  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  32.73 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  34.7 
 
 		 556 aa  286  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 561 aa  264  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 537 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  32.79 
 
 		 548 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  33.11 
 
 		 533 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  31.23 
 
 		 652 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 549 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  30.22 
 
 		 646 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  45.24 
 
 		 565 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  33.58 
 
 		 624 aa  110  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 476 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  32.09 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  39.51 
 
 		 557 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 594 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 481 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 519 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 481 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  31.47 
 
 		 511 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 477 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 491 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 523 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  31.52 
 
 		 506 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 582 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 501 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 473 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.15 
 
 		 507 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 512 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 618 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 479 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 540 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  23.11 
 
 		 592 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  36.63 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 579 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  30.96 
 
 		 503 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  37.43 
 
 		 542 aa  88.6  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  33.7 
 
 		 486 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.05 
 
 		 487 aa  87.4  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  35.39 
 
 		 508 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 582 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 613 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 547 aa  84.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  39.55 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1260  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 685 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296024  normal  0.398588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 664 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 603 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  23.37 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  34.15 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 478 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 514 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  34.48 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  32.09 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 548 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  37.13 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  30.68 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 592 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  29.55 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  30.42 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  35.4 
 
 		 551 aa  77  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  35.56 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  37.6 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 540 aa  74.7  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 574 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 639 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 579 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 522 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  25.58 
 
 		 667 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 497 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 490 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>