82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1692 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  100 
 
 		 583 aa  1194    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  64.13 
 
 		 603 aa  723    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  71.28 
 
 		 568 aa  808    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  69.64 
 
 		 575 aa  747    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  73.07 
 
 		 565 aa  814    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  69.91 
 
 		 574 aa  754    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  73.76 
 
 		 545 aa  835    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  70.94 
 
 		 547 aa  804    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  85.29 
 
 		 443 aa  751    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  40.48 
 
 		 615 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  36.34 
 
 		 776 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  37.14 
 
 		 788 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  37.14 
 
 		 788 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  37.14 
 
 		 788 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  37.5 
 
 		 731 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  37.5 
 
 		 755 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  37.5 
 
 		 755 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  37.5 
 
 		 755 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  37.5 
 
 		 622 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  36.1 
 
 		 765 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  37.55 
 
 		 301 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  33.68 
 
 		 318 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  41.12 
 
 		 388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  38.37 
 
 		 284 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  31.06 
 
 		 375 aa  109  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  40.8 
 
 		 581 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  39.89 
 
 		 763 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  30.4 
 
 		 323 aa  90.9  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3631  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1495 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  25.52 
 
 		 379 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1494 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4340  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1459 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2000  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1498 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.220438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  24.53 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  36.2 
 
 		 863 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1101  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1376 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1611 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  26.84 
 
 		 1481 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2395  leucine-rich repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1497 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1481 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  33.83 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3300  leucine-rich repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1496 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4565  leucine-rich repeat-containing protein  25.68 
 
 		 1640 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2394  leucine-rich repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1473 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1113  leucine-rich repeat-containing protein  25.33 
 
 		 1439 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  26.04 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1395 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.63 
 
 		 892 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3301  leucine-rich repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1473 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1072  leucine-rich repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1439 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1976  leucine-rich repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1393 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0369869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1498 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1395 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1492  leucine-rich repeat domain protein  24.14 
 
 		 1984 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286213  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.06 
 
 		 1041 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2788  leucine-rich repeat protein  32.76 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3829  leucine-rich repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1631 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0683534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1838  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1508 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593101  normal  0.142842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1744 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4093  leucine rich repeat domain protein  30.11 
 
 		 1634 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  36 
 
 		 565 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.04 
 
 		 1015 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  32.34 
 
 		 419 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1302  leucine-rich repeat-containing protein  24.89 
 
 		 1990 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0407416 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  36.94 
 
 		 886 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  26.74 
 
 		 416 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.11 
 
 		 1263 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  30.9 
 
 		 867 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  33.33 
 
 		 482 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.81 
 
 		 1107 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6144  leucine-rich repeat protein  28.14 
 
 		 528 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.55 
 
 		 937 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.55 
 
 		 937 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  33.49 
 
 		 1749 aa  47.8  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  30.66 
 
 		 713 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.55 
 
 		 508 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3149  leucine-rich repeat-containing protein  22.02 
 
 		 1680 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.20756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2074  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  25.63 
 
 		 305 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  33.75 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  28 
 
 		 384 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  30.19 
 
 		 350 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  31.44 
 
 		 296 aa  44.3  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>