134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4138 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 612 aa  1259    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  45.37 
 
 		 602 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  32.76 
 
 		 576 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  30.02 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 576 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  30.7 
 
 		 611 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 576 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 596 aa  165  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  30.87 
 
 		 588 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  28.23 
 
 		 606 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 590 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 540 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 589 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 579 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 549 aa  90.5  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 550 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  22.59 
 
 		 548 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  23.09 
 
 		 650 aa  83.2  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 531 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 568 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 540 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  23.31 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 583 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  23.21 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 600 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 592 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.19 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  21.92 
 
 		 631 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  21.16 
 
 		 570 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  22.56 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.16 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 528 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  22.31 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  22.4 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  22.58 
 
 		 582 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  22.19 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  22.51 
 
 		 636 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  22.82 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  22.72 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  22.77 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 524 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  22.26 
 
 		 499 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 617 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 486 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  22.65 
 
 		 476 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  22.76 
 
 		 478 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 592 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  22.53 
 
 		 582 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 594 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 488 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.17 
 
 		 477 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  22.64 
 
 		 541 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  20.12 
 
 		 599 aa  54.3  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  22.84 
 
 		 579 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  22.99 
 
 		 571 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  21.7 
 
 		 547 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  28.81 
 
 		 667 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  21.96 
 
 		 532 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  22.81 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 514 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  22.26 
 
 		 503 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 508 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  22.02 
 
 		 594 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  22.59 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  20.81 
 
 		 523 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.24 
 
 		 527 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 587 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  20.79 
 
 		 664 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 555 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 499 aa  51.2  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  23.55 
 
 		 520 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 466 aa  50.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 601 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  21.58 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 620 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 618 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 607 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  22.38 
 
 		 568 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  20.64 
 
 		 622 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 633 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  21.68 
 
 		 531 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  25.13 
 
 		 504 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 601 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 494 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 487 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 510 aa  47.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>