More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4011 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3214  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 1111 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  38.02 
 
 		 1089 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  37.91 
 
 		 1099 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  41.9 
 
 		 1007 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  40.98 
 
 		 1011 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  40.41 
 
 		 1080 aa  807    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  37.33 
 
 		 1109 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  43.09 
 
 		 1009 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1119 aa  2269    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  37.5 
 
 		 1108 aa  662    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  40.07 
 
 		 1101 aa  780    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1744  TonB-dependent receptor plug  39.23 
 
 		 1092 aa  764    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  39.67 
 
 		 1138 aa  758    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  38.37 
 
 		 1102 aa  700    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  39.08 
 
 		 1101 aa  712    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  38.33 
 
 		 1127 aa  665    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  44.69 
 
 		 1109 aa  861    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  38.08 
 
 		 1089 aa  680    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  43.66 
 
 		 1093 aa  840    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  36.34 
 
 		 1113 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  39.86 
 
 		 894 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  35.7 
 
 		 1127 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  39.2 
 
 		 1014 aa  569  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1161 aa  476  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3206  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1104 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1110 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.54 
 
 		 1177 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.56 
 
 		 1038 aa  462  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1155 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 		 1114 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 1120 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 1097 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 982 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1128 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.22 
 
 		 1027 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1129 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1096 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1117 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1010 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 1150 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  29.91 
 
 		 1106 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1023 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1116 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 1000 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1148 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1132 aa  420  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1124 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 1037 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1155 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 986 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.3 
 
 		 989 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1152 aa  413  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1177 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  32.2 
 
 		 1043 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1013 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  28.98 
 
 		 1122 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  32.73 
 
 		 1079 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  33.15 
 
 		 1028 aa  406  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1181 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 999 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1140 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1077 aa  399  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 1050 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 1144 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 1029 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1163 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1066 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  32.07 
 
 		 1041 aa  389  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1102 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 1014 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1087 aa  390  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1147 aa  386  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1017 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 1019 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.32 
 
 		 1008 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1096 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1161 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 1026 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  31.28 
 
 		 1023 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1076 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1160 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 1025 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 1128 aa  376  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1076 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1062 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 996 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 		 1051 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1154 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 979 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 1154 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 993 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1173 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 		 1012 aa  369  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1116 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1006 aa  365  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 		 1040 aa  363  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1076 aa  362  3e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1021 aa  361  4e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1071 aa  361  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 1038 aa  361  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>