More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0441 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1062 aa  2162    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1140 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1023 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1027 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  31.64 
 
 		 982 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1129 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 997 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1177 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 999 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  33.23 
 
 		 925 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 1037 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.24 
 
 		 989 aa  416  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1124 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1086 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1154 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 1119 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.63 
 
 		 1010 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 1120 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 1161 aa  402  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1155 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1160 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 986 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1109 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  31.28 
 
 		 1039 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1150 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 1051 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1116 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 1043 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 		 992 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1077 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 1014 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1109 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 1050 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1006 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1028 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 1076 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 1039 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1163 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1132 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1114 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 994 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 1071 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1119 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1038 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  29.23 
 
 		 1071 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 1128 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 1154 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1062 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 1181 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1066 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.17 
 
 		 1024 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 1028 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 979 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1023 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 1051 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.17 
 
 		 1152 aa  363  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1173 aa  361  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1097 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 1000 aa  358  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  28.45 
 
 		 1119 aa  357  5e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1122 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1099 aa  356  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1017 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 1158 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 1177 aa  353  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 1154 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1028 aa  351  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1102 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 1076 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1117 aa  348  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1101 aa  347  5e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 		 1079 aa  347  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  29.05 
 
 		 1019 aa  347  7e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1155 aa  347  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  28.63 
 
 		 1063 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 993 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1127 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 1138 aa  344  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1049 aa  343  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 1030 aa  343  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 1013 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 1019 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1089 aa  340  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 1038 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  29.46 
 
 		 1047 aa  337  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1076 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0136  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1108 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 1008 aa  335  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 1034 aa  334  5e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1164 aa  334  6e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1075 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1080 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1040 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.68 
 
 		 1147 aa  331  6e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  28.28 
 
 		 996 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1023 aa  330  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1172 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1148 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1006 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1143 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>