More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1334 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1334  MATE efflux family protein  100 
 
 
478 aa  937    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.402123  normal  0.231405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  36.01 
 
 
454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  34.69 
 
 
451 aa  236  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02728  MATE efflux family protein  32.59 
 
 
460 aa  227  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0324679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  33.33 
 
 
462 aa  222  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  32.72 
 
 
453 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  31.29 
 
 
452 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0640  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
454 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.690668  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0470  MATE efflux family protein  31.61 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.11231  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
451 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
455 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  30.39 
 
 
455 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  30.39 
 
 
455 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0666  MATE efflux family protein  30.39 
 
 
455 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3662  MATE efflux family protein  30.92 
 
 
476 aa  196  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000389251  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0553  MATE efflux family protein  31.58 
 
 
452 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3691  MATE efflux family protein  30.84 
 
 
453 aa  190  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.830643  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3399  MATE efflux family protein  31.35 
 
 
452 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00107141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3569  MATE efflux family protein  30.47 
 
 
452 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0796958  normal  0.0492062 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3126  MATE efflux family protein  30.39 
 
 
455 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.113083  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0420  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
459 aa  186  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000768677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0699  MATE efflux family protein  30.25 
 
 
456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2626  MATE efflux family protein  32.11 
 
 
467 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287795  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2244  hypothetical protein  29.74 
 
 
460 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00144  multidrug efflux pump  29.81 
 
 
456 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3884  multi anti extrusion protein MatE  32.37 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.316697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002223  Na+-driven multidrug efflux pump  29.63 
 
 
428 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.851646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  32.1 
 
 
453 aa  150  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3527  MATE efflux family protein  30.96 
 
 
443 aa  149  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755877  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  32.05 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2374  MATE efflux family protein  31.09 
 
 
509 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4099  MATE efflux family protein  31.09 
 
 
442 aa  146  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1639  MATE efflux family protein  29.49 
 
 
466 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
520 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
520 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  30.86 
 
 
517 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1822  MATE efflux family protein  28.3 
 
 
505 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.35 
 
 
460 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2639  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1825  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559247  normal  0.52538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2526  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
515 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2765  MATE efflux family protein  29.7 
 
 
503 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.256574  normal  0.220572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  30.28 
 
 
505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  26.03 
 
 
462 aa  141  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3487  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
459 aa  141  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2519  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
515 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
460 aa  140  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
468 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  25.64 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1591  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
521 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
477 aa  136  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2191  MATE efflux family protein  26.33 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114435  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05345  Na+-driven multidrug efflux pump  29.75 
 
 
445 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000543  Na+-driven multidrug efflux pump  29.33 
 
 
427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1492  MATE efflux family protein  28.8 
 
 
495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0249  hypothetical protein  27.97 
 
 
444 aa  134  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  27.64 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.46 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  26.38 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2280  MATE efflux family protein  30.32 
 
 
531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
437 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01514  hypothetical protein  27.29 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.51 
 
 
437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1558  MATE efflux family protein  27.52 
 
 
516 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3799  Fis family transcriptional regulator  26.57 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.732609  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2709  MATE efflux family protein  27.07 
 
 
454 aa  126  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.74149  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
454 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  23.58 
 
 
460 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.14 
 
 
448 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.66 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  25.71 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1831  MATE efflux family protein  32.07 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  29.35 
 
 
473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.68 
 
 
453 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  23.71 
 
 
452 aa  119  9e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0285  MATE efflux family protein  30.33 
 
 
465 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.47505 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  25.96 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.93 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.14 
 
 
518 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.42 
 
 
460 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  27.36 
 
 
486 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  24.88 
 
 
470 aa  117  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
454 aa  116  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.76 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  27.9 
 
 
457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  22.78 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  24.07 
 
 
439 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
447 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  24.12 
 
 
460 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.21 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  24.82 
 
 
460 aa  114  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  26.56 
 
 
481 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  24.03 
 
 
498 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3634  MATE efflux family protein  28.57 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1992  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.38 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>