144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1043 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1315    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  38.01 
 
 		 799 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  33.4 
 
 		 794 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  32.88 
 
 		 822 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  32.16 
 
 		 792 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  37.97 
 
 		 735 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  40 
 
 		 751 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  24.47 
 
 		 637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  25.54 
 
 		 615 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  28.03 
 
 		 1371 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  29.07 
 
 		 938 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1313 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  30.81 
 
 		 1222 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  27.92 
 
 		 642 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28.23 
 
 		 627 aa  97.1  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  23.49 
 
 		 886 aa  97.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.54 
 
 		 1389 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  28.1 
 
 		 662 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1488 aa  92  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  34.03 
 
 		 890 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  29.31 
 
 		 2367 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  29.31 
 
 		 2411 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.45 
 
 		 2807 aa  88.6  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  29.45 
 
 		 2454 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  34.06 
 
 		 1162 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  31.62 
 
 		 2421 aa  87  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.33 
 
 		 3227 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1245 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  30.82 
 
 		 1140 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  31.85 
 
 		 650 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  31.65 
 
 		 2772 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1287 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  33.48 
 
 		 815 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  36.11 
 
 		 885 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  28.74 
 
 		 490 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  42.35 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  27.15 
 
 		 2980 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  28.15 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  30.22 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  36.81 
 
 		 1059 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.32 
 
 		 3682 aa  77  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  29.08 
 
 		 750 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  26.77 
 
 		 1230 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  36.13 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.65 
 
 		 1606 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.12 
 
 		 1620 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  33.59 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.39 
 
 		 808 aa  73.9  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  33.01 
 
 		 2972 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  26.4 
 
 		 1345 aa  71.6  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1064 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.95 
 
 		 3542 aa  70.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  39.33 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  27.94 
 
 		 3851 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  29.44 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  41.33 
 
 		 5745 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  33.07 
 
 		 1466 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.02 
 
 		 3324 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  29.19 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  31.9 
 
 		 1602 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  42.03 
 
 		 652 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  25.4 
 
 		 969 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.21 
 
 		 4071 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  26.75 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  39.81 
 
 		 2064 aa  67  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  28.45 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0981  hypothetical protein  24.36 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  29.06 
 
 		 503 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  23.65 
 
 		 1463 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  27.03 
 
 		 1152 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  38.78 
 
 		 2005 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  44.78 
 
 		 3793 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  37.04 
 
 		 658 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  42.86 
 
 		 4896 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.01 
 
 		 2296 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  32.95 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  26.16 
 
 		 742 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  21.48 
 
 		 1228 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1193 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  28.99 
 
 		 963 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  31.11 
 
 		 4429 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  23.38 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  32.48 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1980 aa  60.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  41.27 
 
 		 711 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.21 
 
 		 2377 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  35.37 
 
 		 2833 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  41.1 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  22.8 
 
 		 657 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1139 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  29.12 
 
 		 1259 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1100 aa  57.8  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1163 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  25.89 
 
 		 1657 aa  57.4  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  41.89 
 
 		 852 aa  57.4  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  23.63 
 
 		 873 aa  57  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1329 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  32.63 
 
 		 2588 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1547 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>