More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5550 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 520 aa  1068    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  44.75 
 
 		 531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  31.38 
 
 		 499 aa  210  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.2 
 
 		 483 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 		 513 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 479 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  31.43 
 
 		 473 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  32.43 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  31.05 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.97 
 
 		 491 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 476 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 481 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 483 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  30.63 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 506 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  30.86 
 
 		 512 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.86 
 
 		 494 aa  150  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  31.13 
 
 		 470 aa  148  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  29.15 
 
 		 519 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.91 
 
 		 490 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 511 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 486 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 508 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.74 
 
 		 494 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.28 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 499 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 485 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 514 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.99 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.27 
 
 		 476 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 501 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 531 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 511 aa  126  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 498 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 503 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 488 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 506 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 503 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.32 
 
 		 498 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 557 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 618 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  27.18 
 
 		 532 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 519 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 622 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 576 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 601 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 664 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.33 
 
 		 507 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  33.95 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 456 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 579 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 527 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 534 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 541 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  28.03 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>