More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4975 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1055 aa  2148    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  43.04 
 
 		 1128 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  60.87 
 
 		 1065 aa  1317    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  43.56 
 
 		 1148 aa  862    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  34.89 
 
 		 1047 aa  562  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 1074 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1033 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 1086 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 1056 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1095 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1095 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1079 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 1061 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1046 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1045 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 1144 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1128 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1127 aa  344  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 1053 aa  344  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.76 
 
 		 1168 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1155 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1026 aa  337  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 989 aa  337  5e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 1094 aa  337  5.999999999999999e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1037 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 1031 aa  331  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1036 aa  330  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1164 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1145 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1130 aa  328  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 986 aa  327  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1036 aa  327  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1056 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1161 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1029 aa  323  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 1146 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1006 aa  323  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  26.68 
 
 		 1029 aa  322  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1123 aa  317  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 1026 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1020 aa  313  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1010 aa  310  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1052 aa  310  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1058 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1138 aa  308  3e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 1011 aa  307  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1177 aa  307  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1109 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1006 aa  306  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1038 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1027 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1128 aa  303  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 1049 aa  303  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1039 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 982 aa  301  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1066 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  28.16 
 
 		 1188 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1036 aa  297  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1064 aa  297  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1084 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1008 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1064 aa  295  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 1130 aa  295  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 1128 aa  294  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1013 aa  291  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 993 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 994 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1082 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1028 aa  289  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  27.44 
 
 		 1005 aa  288  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1139 aa  288  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  26.73 
 
 		 1023 aa  287  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1077 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1023 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 1060 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 1025 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 1164 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1102 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 996 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1142 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 1008 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1013 aa  284  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1179 aa  284  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 1041 aa  283  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 1033 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 1018 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1019 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1099 aa  281  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1051 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1096 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1124 aa  281  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1192 aa  281  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1131 aa  280  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1097 aa  280  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1148 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 1050 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 1175 aa  278  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1043 aa  278  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1181 aa  278  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 937 aa  278  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>