240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5827 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 264 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 654 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  38.64 
 
 		 1022 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  39.92 
 
 		 453 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  40.19 
 
 		 1014 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  38.46 
 
 		 1020 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  39.02 
 
 		 950 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.71 
 
 		 496 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  40.24 
 
 		 378 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  40.08 
 
 		 940 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  38.19 
 
 		 921 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  38.18 
 
 		 992 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  44.08 
 
 		 1110 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  37.26 
 
 		 631 aa  131  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  43.89 
 
 		 1092 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 1108 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 		 1100 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 1005 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.74 
 
 		 919 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  37.84 
 
 		 992 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  37.35 
 
 		 921 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  39.17 
 
 		 954 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  35.32 
 
 		 621 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3100  transcriptional regulator, SARP family  37.11 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.534297  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.29 
 
 		 1010 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  37.75 
 
 		 370 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  41.9 
 
 		 1072 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  35.08 
 
 		 995 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 622 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  36.08 
 
 		 990 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  36.49 
 
 		 1022 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 1058 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 1003 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  38.57 
 
 		 1025 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 1158 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  39.36 
 
 		 1088 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  43.81 
 
 		 1087 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.8 
 
 		 981 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  33.83 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 996 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 621 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  32.92 
 
 		 1027 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5071  SARP family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 296 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  41.55 
 
 		 960 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  38.01 
 
 		 919 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 1043 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 907 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 1186 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  33.6 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  37.67 
 
 		 1733 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 1033 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.63 
 
 		 965 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.2 
 
 		 1093 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.68 
 
 		 934 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  35.77 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  38.1 
 
 		 1699 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 1042 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 1097 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  39.64 
 
 		 926 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  39.52 
 
 		 1028 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  36.55 
 
 		 1339 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  36.51 
 
 		 913 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2444  SARP family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.93 
 
 		 1102 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  38.84 
 
 		 1000 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.62 
 
 		 1048 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 1151 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  36.55 
 
 		 1017 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.99 
 
 		 1030 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  35.27 
 
 		 1123 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  36.2 
 
 		 931 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 983 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  37.95 
 
 		 990 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3688  transcriptional regulator, SARP family  34.55 
 
 		 348 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  35.23 
 
 		 930 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 952 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  41.56 
 
 		 1125 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  35.43 
 
 		 989 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  35.02 
 
 		 946 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  39.92 
 
 		 1227 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  37.27 
 
 		 1025 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  36.53 
 
 		 1003 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 968 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 1048 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 		 957 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  38.74 
 
 		 1103 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 964 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.85 
 
 		 1058 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 993 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 1004 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.61 
 
 		 1050 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  34.52 
 
 		 379 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.26 
 
 		 1121 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  33.48 
 
 		 1090 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>