227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3399 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3399  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 647 aa  1234    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00991696  normal  0.321929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  47.55 
 
 		 655 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3349  SARP family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 628 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2165  transcriptional regulator, SARP family  46.57 
 
 		 676 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  40.44 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  46.98 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  43.48 
 
 		 1153 aa  173  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  38.27 
 
 		 1036 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  44.13 
 
 		 1090 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  40.73 
 
 		 1114 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  40.38 
 
 		 969 aa  157  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  43.75 
 
 		 1123 aa  154  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  40.32 
 
 		 1123 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  42.29 
 
 		 1118 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  40.41 
 
 		 1121 aa  151  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 1161 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.37 
 
 		 1339 aa  137  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  39.02 
 
 		 965 aa  135  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  37.96 
 
 		 981 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  38.26 
 
 		 1733 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.62 
 
 		 1150 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  35.58 
 
 		 1071 aa  122  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 1000 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  37.05 
 
 		 940 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  39.47 
 
 		 1132 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  39.18 
 
 		 1158 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 378 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.89 
 
 		 957 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  35.6 
 
 		 1093 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  34.87 
 
 		 934 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  35.86 
 
 		 1018 aa  111  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  39.76 
 
 		 1699 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  37.31 
 
 		 1186 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  37.3 
 
 		 1102 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  36.95 
 
 		 993 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  36.48 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 622 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  36.26 
 
 		 990 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  37.69 
 
 		 1097 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 		 1014 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  33.59 
 
 		 943 aa  108  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.13 
 
 		 1010 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.19 
 
 		 496 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.14 
 
 		 1092 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.78 
 
 		 1017 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  35.48 
 
 		 1003 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  36.48 
 
 		 950 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  35.74 
 
 		 1005 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.08 
 
 		 631 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 1151 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1022 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  35.41 
 
 		 1100 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  34.29 
 
 		 921 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 621 aa  104  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 1071 aa  103  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 1319 aa  103  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2925  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 668 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 1346 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 1043 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  34.43 
 
 		 1003 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  38.46 
 
 		 915 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35 
 
 		 960 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  33.21 
 
 		 388 aa  102  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5752  SARP family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 276 aa  102  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  37.14 
 
 		 1125 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  39.75 
 
 		 1146 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  36.33 
 
 		 1030 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.52 
 
 		 919 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 963 aa  100  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  28.76 
 
 		 666 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  37.1 
 
 		 1033 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.18 
 
 		 1088 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 1141 aa  97.8  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  34.04 
 
 		 931 aa  97.8  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 654 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 1027 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  30.49 
 
 		 621 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  38.86 
 
 		 926 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  37.45 
 
 		 910 aa  95.9  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  35.37 
 
 		 954 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  31.6 
 
 		 379 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  32.66 
 
 		 990 aa  95.5  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  32.81 
 
 		 833 aa  95.5  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  37.6 
 
 		 1025 aa  95.1  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  31.3 
 
 		 267 aa  94.7  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  35.6 
 
 		 935 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 268 aa  94.4  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  32.41 
 
 		 943 aa  94  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.12 
 
 		 1055 aa  94  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 1028 aa  94  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.2 
 
 		 983 aa  93.6  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.35 
 
 		 1072 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.25 
 
 		 1048 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 1027 aa  92.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  36.48 
 
 		 963 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 786 aa  92.8  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 1058 aa  92  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 292 aa  92  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 981 aa  91.3  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>