275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1474 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 668 aa  1336    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  58.38 
 
 		 676 aa  752    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  55.72 
 
 		 831 aa  617  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  55.03 
 
 		 930 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  40.41 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  40.95 
 
 		 1293 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  58.1 
 
 		 387 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  55.12 
 
 		 343 aa  359  8e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  56.82 
 
 		 390 aa  352  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  42.35 
 
 		 522 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  58.89 
 
 		 346 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  46.84 
 
 		 391 aa  316  8e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  53.08 
 
 		 579 aa  300  7e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  49.84 
 
 		 930 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  48.98 
 
 		 709 aa  281  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  52.1 
 
 		 627 aa  279  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  49.1 
 
 		 752 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  34.11 
 
 		 1030 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  47.65 
 
 		 491 aa  253  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  45.13 
 
 		 392 aa  244  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  30.48 
 
 		 963 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.59 
 
 		 1750 aa  219  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1026 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.08 
 
 		 1292 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1068 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.27 
 
 		 786 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  38.35 
 
 		 525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  31.11 
 
 		 652 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.93 
 
 		 1130 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  34.62 
 
 		 319 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  38.21 
 
 		 1079 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.98 
 
 		 1146 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  35.23 
 
 		 1163 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  33.58 
 
 		 307 aa  156  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  34.74 
 
 		 1140 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1051 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1230 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.81 
 
 		 2296 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  34.11 
 
 		 646 aa  143  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  33.67 
 
 		 359 aa  143  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  32.23 
 
 		 439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  32.1 
 
 		 355 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  34.03 
 
 		 903 aa  140  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  31.29 
 
 		 343 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.6 
 
 		 372 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  34.38 
 
 		 373 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  34.18 
 
 		 353 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  32.21 
 
 		 354 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  36 
 
 		 343 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  32.34 
 
 		 321 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.38 
 
 		 1351 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  31.87 
 
 		 323 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.1 
 
 		 347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.23 
 
 		 322 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  31.05 
 
 		 318 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 		 850 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  33.21 
 
 		 355 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  35.71 
 
 		 361 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1030 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  34.32 
 
 		 1177 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  36.74 
 
 		 365 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  31.76 
 
 		 368 aa  127  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  32.33 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  31.85 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.06 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  72.37 
 
 		 735 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  76.71 
 
 		 958 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  37.22 
 
 		 664 aa  120  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  34.96 
 
 		 418 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  66.67 
 
 		 488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  71.05 
 
 		 627 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  30.98 
 
 		 315 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  34.43 
 
 		 384 aa  119  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  69.86 
 
 		 581 aa  117  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  39.59 
 
 		 739 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  51.72 
 
 		 479 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.86 
 
 		 700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  29.85 
 
 		 326 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 892 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  80.95 
 
 		 522 aa  114  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 772 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  29.85 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  30.89 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  32.83 
 
 		 343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1763 aa  112  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  30.47 
 
 		 379 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  64.1 
 
 		 848 aa  111  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  65.71 
 
 		 749 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  62.03 
 
 		 787 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.31 
 
 		 412 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  68.06 
 
 		 919 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  68.12 
 
 		 110 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  29.41 
 
 		 318 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  66.67 
 
 		 294 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  31.5 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  32.82 
 
 		 888 aa  107  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  61.64 
 
 		 869 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  32.04 
 
 		 386 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  73.02 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>